More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2451 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
207 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  77.07 
 
 
210 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  63.73 
 
 
228 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  59.8 
 
 
208 aa  221  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
207 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  55.29 
 
 
218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 
204 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  45.64 
 
 
198 aa  155  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  46.97 
 
 
215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 
210 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  45.5 
 
 
226 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 
225 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  45.92 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  45.73 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  41 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  43.96 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 
249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 
232 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40.59 
 
 
203 aa  124  9e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
200 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  44.06 
 
 
234 aa  121  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  43.66 
 
 
232 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  44.56 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  43.68 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  43.98 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 
220 aa  111  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  42.02 
 
 
225 aa  111  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  39.04 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
201 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 
201 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  31.67 
 
 
272 aa  104  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
211 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 
225 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.43 
 
 
218 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 
225 aa  101  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
206 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 
207 aa  99.8  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.92 
 
 
214 aa  99.4  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
445 aa  99  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.7 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.96 
 
 
382 aa  96.3  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  39.35 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 
209 aa  95.5  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
209 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 
210 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 
214 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
209 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
217 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 
213 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.46 
 
 
442 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.27 
 
 
442 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.81 
 
 
442 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.81 
 
 
442 aa  92  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
224 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
213 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.98 
 
 
443 aa  91.7  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  34.11 
 
 
232 aa  91.7  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35 
 
 
442 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  42.42 
 
 
206 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
447 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  39.57 
 
 
189 aa  89  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.77 
 
 
442 aa  89  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
223 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
448 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
448 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 
205 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  30.86 
 
 
281 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
212 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  44.83 
 
 
440 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 
227 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
233 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.87 
 
 
378 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 
223 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
230 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  32.8 
 
 
196 aa  85.5  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.14 
 
 
378 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
214 aa  85.1  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>