More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2446 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  100 
 
 		 509 aa  988    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  67.41 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  67.82 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  65.59 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  65.94 
 
 		 508 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  63.37 
 
 		 509 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  62.26 
 
 		 520 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  57.17 
 
 		 529 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  59.24 
 
 		 521 aa  519  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  59.09 
 
 		 575 aa  519  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  61.43 
 
 		 499 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  58.99 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  59.59 
 
 		 495 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  58.04 
 
 		 498 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  57.2 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  56.39 
 
 		 491 aa  488  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  57.14 
 
 		 507 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  58.66 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  56.25 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  58.3 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  58.32 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  58.32 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  58.32 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  54.13 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  55.58 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  47.13 
 
 		 491 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  46.31 
 
 		 491 aa  411  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  44.82 
 
 		 513 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  45.02 
 
 		 506 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  45.02 
 
 		 506 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  49.8 
 
 		 495 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  44.82 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  45.12 
 
 		 485 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  40.08 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  46.29 
 
 		 508 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  50 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  51.32 
 
 		 496 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  43.98 
 
 		 534 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  50 
 
 		 481 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.08 
 
 		 506 aa  390  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.38 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.69 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 503 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  43.68 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.46 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  47.34 
 
 		 484 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  46.25 
 
 		 484 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  47.06 
 
 		 518 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  47.33 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  49.17 
 
 		 490 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  49.59 
 
 		 485 aa  388  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  45.78 
 
 		 489 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  46.93 
 
 		 484 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  48.67 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  46.72 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  48.3 
 
 		 498 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  44.55 
 
 		 500 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  46.95 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  40.79 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  45.89 
 
 		 487 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  49.29 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  47.93 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.81 
 
 		 495 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  43.56 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0815  cobyric acid synthase CobQ  50.51 
 
 		 483 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  39.8 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  42.51 
 
 		 536 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  49.4 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.63 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  46.57 
 
 		 486 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  46.78 
 
 		 486 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  48.05 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  48.53 
 
 		 500 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  47.75 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  45.71 
 
 		 485 aa  376  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  48.33 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  41.84 
 
 		 488 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43.52 
 
 		 541 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  49.79 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  48.33 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  48.23 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  45.6 
 
 		 502 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3640  cobyric acid synthase CobQ  44.35 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.63 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  42.29 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  49.19 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  46.6 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  41.53 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2864  cobyric acid synthase  44.67 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  42.69 
 
 		 527 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  48.13 
 
 		 500 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.31 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  43.5 
 
 		 863 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>