225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2401 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 258 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  73.54 
 
 		 251 aa  355  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  61.09 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  60.47 
 
 		 254 aa  291  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  58.43 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  59.77 
 
 		 250 aa  285  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  57.36 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 255 aa  271  9e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  59.77 
 
 		 254 aa  270  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  54.69 
 
 		 252 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  59.38 
 
 		 301 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  55.25 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  57.2 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  56.64 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  57.03 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  51.95 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  54.9 
 
 		 254 aa  261  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  52.33 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  54.51 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  52.92 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  54.47 
 
 		 254 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  54.12 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  49.81 
 
 		 258 aa  251  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  53.52 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  51.56 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  54.72 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  55.25 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  53.91 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  52.14 
 
 		 255 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  52.34 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  50.58 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  52.9 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  48.16 
 
 		 259 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  47.66 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  43.58 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  47.47 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  45.35 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  49.6 
 
 		 251 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  52.34 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  47.54 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  48.26 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  49.42 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  48.79 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  43.97 
 
 		 257 aa  219  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 253 aa  218  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  46.56 
 
 		 259 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  47.13 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  49.03 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  49.03 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  47.18 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  48.44 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  43.97 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  43.97 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  42.06 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  45.35 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  40.48 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  47.66 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  47.66 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  40.48 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  40.08 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  43.63 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  47.27 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  46.27 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  44.31 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  46.46 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  42.75 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  39.15 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  38.82 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  46.06 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  37.65 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  45.28 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  45.71 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0716  LamB/YcsF family protein  42.8 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0495612  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  46.64 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  45.56 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  38.04 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  44.88 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>