216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2368 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 425 aa  834    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  80.35 
 
 		 404 aa  594  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1642  putative transcriptional regulator, PucR family  64.08 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2948  putative transcriptional regulator, PucR family  61.54 
 
 		 420 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0167209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1972  hypothetical protein  60 
 
 		 373 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0879  hypothetical protein  58.13 
 
 		 384 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0278062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  53.05 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  55.96 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6808  putative transcriptional regulator, PucR family  56.04 
 
 		 421 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3509  putative transcriptional regulator, PucR family  53.99 
 
 		 392 aa  354  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  53.46 
 
 		 419 aa  351  1e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1991  CdaR family transcriptional regulator  52 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2204  putative transcriptional regulator, PucR family  51.71 
 
 		 414 aa  342  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000832377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  55.05 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4807  putative transcriptional regulator, PucR family  50 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.525155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2465  hypothetical protein  51.29 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00557093  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3377  hypothetical protein  53.56 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.541372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3619  PucR family transcriptional regulator  52.77 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000689812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  51.02 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  46.24 
 
 		 539 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3342  putative transcriptional regulator, PucR family  51.13 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.455149  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  47.26 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09330  hypothetical protein  45.45 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.484292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  47.4 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  43.73 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  47.83 
 
 		 393 aa  275  8e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2052  putative transcriptional regulator, PucR family  47.01 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.171524  decreased coverage  0.00281905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  45.05 
 
 		 429 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  42.39 
 
 		 428 aa  249  7e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3363  hypothetical protein  43.58 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3374  hypothetical protein  43.58 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  42.49 
 
 		 414 aa  243  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3425  hypothetical protein  43.32 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.435185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2780  hypothetical protein  42.04 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311956  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1266  PucR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 479 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.330502 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1627  regulator of polyketide synthase expression  41.21 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1203  hypothetical protein  46.73 
 
 		 453 aa  96.7  7e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  42.86 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0143  transcriptional regulator, CdaR  33.81 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1521  CdaR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000148841  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3096  purine catabolism PurC domain-containing protein  44.29 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1213  transcriptional regulator, CdaR  32.11 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  37.62 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  44.29 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2051  PucR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 526 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.4241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3995  putative carbohydrate diacid regulator  32.11 
 
 		 371 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.859873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1349  putative carbohydrate diacid regulator  32.11 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6541  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.193415 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 563 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1019  transcriptional regulator, CdaR  27.22 
 
 		 371 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0948  transcriptional regulator, CdaR  34.09 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.171254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4288  transcriptional regulator, CdaR  56.6 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.743775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0393  putative transcriptional regulator, PucR family  27.07 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1211  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1189  carbohydrate diacid regulator  31.03 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1310  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  34.53 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1387  putative carbohydrate diacid regulator  31.03 
 
 		 371 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  45.16 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  31.96 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4574  transcriptional regulator, CdaR  30.16 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3378  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.51 
 
 		 445 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0484  transcriptional regulator, CdaR  31.65 
 
 		 404 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2117  CdaR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 379 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1411  transcriptional regulator, putative  30.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1451  putative carbohydrate diacid regulator  30.28 
 
 		 371 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1191  carbohydrate diacid regulator  30.17 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5287  CdaR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5376  CdaR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5666  CdaR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  41.46 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3217  transcriptional regulator, CdaR  60.42 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250091  normal  0.197749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  40 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0117  transcriptional regulator, CdaR  46.48 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.646192  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  32.57 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  40 
 
 		 659 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2197  transcriptional regulator, PucR family  38.24 
 
 		 540 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000143617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2351  CdaR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000556727  normal  0.18392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  35.07 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  49.15 
 
 		 514 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2290  transcriptional regulator, CdaR  32.52 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0424892 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  27.4 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  35.82 
 
 		 558 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  41.67 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2017  CdaR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.294249  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  40.96 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  39.19 
 
 		 459 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5594  PucR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  45.16 
 
 		 525 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000884  sugar diacid utilization regulator SdaR  45.65 
 
 		 380 aa  50.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1323  transcriptional regulator, CdaR  36.78 
 
 		 554 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2339  hypothetical protein  21.21 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  51.79 
 
 		 365 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  36.92 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  34.29 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>