More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2336 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  557  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  56.79 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  53.87 
 
 		 283 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  51.76 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  47.92 
 
 		 288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.53 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  44.88 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  45.49 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  43.6 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  45.49 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  45.49 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  45.64 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  45.45 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.69 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  45.14 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  39.51 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  42.25 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  44.49 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  37.95 
 
 		 293 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  36.11 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  36.33 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  41.41 
 
 		 296 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.46 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.81 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  39.93 
 
 		 293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  42.49 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.9 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.25 
 
 		 347 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  40 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  39.65 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  34.33 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  40.61 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.79 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  37.72 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  38.44 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.36 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  39.08 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 296 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.11 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  37.76 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.59 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  34.15 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  38.21 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.59 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  35.49 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  33.45 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  34.93 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  37.92 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  36 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  40.96 
 
 		 393 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  38.52 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 289 aa  118  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  38.19 
 
 		 339 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.95 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  37.24 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  36.24 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  38.59 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  34.71 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2000  UspA domain protein  33.79 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0511167  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  35.74 
 
 		 322 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.9 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  35.64 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.5 
 
 		 295 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.59 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  36.52 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.56 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  37.15 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  34.49 
 
 		 272 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  33.1 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.67 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  34.09 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  40.07 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  37.85 
 
 		 325 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  34.04 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.2 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1479  UspA domain protein  37.06 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0352418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>