More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2334 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  569  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  55.63 
 
 
289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  54.04 
 
 
288 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  54.39 
 
 
288 aa  273  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  49.29 
 
 
292 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  46.32 
 
 
299 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  45.99 
 
 
282 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  43.49 
 
 
287 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  43.84 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  43.36 
 
 
283 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  43.66 
 
 
284 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  41.16 
 
 
291 aa  178  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  41.84 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  42.86 
 
 
288 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  37.25 
 
 
347 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  41.07 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  40.86 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  44.95 
 
 
289 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  39.18 
 
 
293 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  36.82 
 
 
293 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  41.87 
 
 
296 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  36.86 
 
 
288 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  43.89 
 
 
229 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  38.24 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  37.71 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  37.59 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.86 
 
 
289 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  39.66 
 
 
296 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  35.96 
 
 
293 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  39.25 
 
 
298 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  35.88 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  37.02 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  35.03 
 
 
289 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.67 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.56 
 
 
294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  36.95 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  36.95 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  42 
 
 
294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
296 aa  129  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  38.97 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  38.97 
 
 
293 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  35.62 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  38.75 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  40.94 
 
 
300 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  33.89 
 
 
294 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 
294 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  40.35 
 
 
325 aa  125  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1145  UspA domain protein  36.73 
 
 
301 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  35.96 
 
 
277 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  36.27 
 
 
306 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  36.82 
 
 
294 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  34.35 
 
 
294 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  36.59 
 
 
297 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 
293 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  37.77 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.71 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.71 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  36.21 
 
 
373 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  36.55 
 
 
289 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  33.67 
 
 
297 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  38.57 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  33.79 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  36.17 
 
 
277 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
341 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  32.65 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.66 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  37.25 
 
 
323 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
295 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  35.95 
 
 
321 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.8 
 
 
276 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  37 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  32.5 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.68 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  34.38 
 
 
290 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  38.83 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  38.54 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  38.54 
 
 
294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  35.35 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 
295 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.24 
 
 
317 aa  109  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.44 
 
 
339 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  36.77 
 
 
302 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  36.46 
 
 
393 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.53 
 
 
304 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  35.99 
 
 
302 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  38.41 
 
 
274 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1833  UspA domain protein  37.59 
 
 
342 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0847869  normal  0.369126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 
381 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  29.87 
 
 
341 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  35.42 
 
 
289 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.49 
 
 
290 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>