162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2318 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 		 512 aa  1040    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  55.38 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  50.76 
 
 		 519 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.49 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  43.76 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  44.42 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  40.81 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.89 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  41.18 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  42.62 
 
 		 581 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  41.18 
 
 		 566 aa  355  8.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  43.33 
 
 		 484 aa  338  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  42.12 
 
 		 497 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  42.91 
 
 		 496 aa  330  4e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.55 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  53 
 
 		 542 aa  316  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  39.85 
 
 		 556 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  38.78 
 
 		 523 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  37.68 
 
 		 550 aa  289  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 571 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  39.37 
 
 		 532 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.7 
 
 		 547 aa  270  5.9999999999999995e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 512 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  38.85 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 514 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  35.74 
 
 		 498 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  48.45 
 
 		 451 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.97 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  34.39 
 
 		 497 aa  242  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.96 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.01 
 
 		 536 aa  239  9e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  36.45 
 
 		 526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  35.21 
 
 		 546 aa  236  8e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.51 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.64 
 
 		 539 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.57 
 
 		 537 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  35.29 
 
 		 541 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 636 aa  229  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.38 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 		 540 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.12 
 
 		 559 aa  212  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  31 
 
 		 558 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  36.34 
 
 		 590 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  36.36 
 
 		 539 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  29.32 
 
 		 553 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  36.17 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  28.04 
 
 		 552 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.6 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  29.16 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.79 
 
 		 562 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.9 
 
 		 536 aa  160  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  32.46 
 
 		 537 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  35.31 
 
 		 504 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 525 aa  157  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  30.44 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.84 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  30.44 
 
 		 522 aa  153  7e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 543 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  34.32 
 
 		 1338 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 572 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 		 547 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  25.94 
 
 		 746 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 1195 aa  139  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 665 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  25.48 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.92 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  27.5 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.82 
 
 		 540 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  30.7 
 
 		 518 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  34.85 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.83 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  27.68 
 
 		 650 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.14 
 
 		 530 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 534 aa  123  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  26.18 
 
 		 545 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  27.62 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.92 
 
 		 1474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  24.06 
 
 		 508 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 		 691 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  23 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  24.31 
 
 		 495 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.76 
 
 		 365 aa  99  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.34 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  27.32 
 
 		 1585 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 345 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  27.01 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.16 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  24.8 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  28.63 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  25.35 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  26.23 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  26.72 
 
 		 532 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  30.49 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  42.02 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  34.87 
 
 		 901 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  28.52 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  25.86 
 
 		 699 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.72 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>