153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2304 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  866    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  67.28 
 
 
438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  58.35 
 
 
441 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  49.41 
 
 
434 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  54.14 
 
 
432 aa  428  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  52.94 
 
 
433 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.79 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  46.06 
 
 
437 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  44.24 
 
 
425 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  46.71 
 
 
437 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  47.11 
 
 
437 aa  351  1e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  45.33 
 
 
438 aa  351  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  45.62 
 
 
452 aa  346  4e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  44.52 
 
 
447 aa  346  6e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  43.84 
 
 
428 aa  342  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  44.08 
 
 
473 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  41.49 
 
 
439 aa  327  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  42.16 
 
 
486 aa  324  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  41.01 
 
 
475 aa  296  4e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  41.65 
 
 
470 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  35.38 
 
 
437 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  35.38 
 
 
437 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  35.38 
 
 
434 aa  280  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.67 
 
 
437 aa  278  9e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  38.23 
 
 
445 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.67 
 
 
437 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.43 
 
 
437 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
437 aa  278  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.43 
 
 
437 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  34.91 
 
 
438 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.67 
 
 
437 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  34.58 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  36.38 
 
 
442 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  34.88 
 
 
436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  36.15 
 
 
464 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  34.43 
 
 
464 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.15 
 
 
460 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  35.62 
 
 
440 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  33.26 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.88 
 
 
445 aa  205  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  32.43 
 
 
429 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  31.88 
 
 
412 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.64 
 
 
409 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  31.01 
 
 
423 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  32.04 
 
 
424 aa  192  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  30.41 
 
 
478 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  32.72 
 
 
415 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  32.12 
 
 
415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  31.81 
 
 
415 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.18 
 
 
439 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  35.04 
 
 
466 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  29.67 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  30.32 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.78 
 
 
449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.13 
 
 
429 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  30.94 
 
 
446 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  29.95 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.79 
 
 
462 aa  141  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
421 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.56 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  27.75 
 
 
437 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.8 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  28.77 
 
 
418 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  26.19 
 
 
574 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  27.1 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  25.68 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  31.37 
 
 
246 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  27.89 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 
424 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  22.62 
 
 
642 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  30.63 
 
 
572 aa  96.7  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.51 
 
 
504 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  28.25 
 
 
483 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.7 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  30.11 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.37 
 
 
454 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  25.24 
 
 
539 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.89 
 
 
462 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  24.57 
 
 
453 aa  60.1  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  20.45 
 
 
478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  33.85 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  23.11 
 
 
464 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  19.5 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  28.4 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  28.57 
 
 
480 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  23.5 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.5 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.5 
 
 
456 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  27.65 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  28.74 
 
 
558 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  18.34 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  18.75 
 
 
471 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.89 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  19.26 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  31.43 
 
 
476 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  29.31 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  18.95 
 
 
478 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  18.6 
 
 
468 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>