More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2298 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  84.19 
 
 		 215 aa  357  9e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  82.03 
 
 		 217 aa  348  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  77.88 
 
 		 217 aa  333  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.19 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  71.89 
 
 		 218 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  72.3 
 
 		 214 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.36 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  66.82 
 
 		 218 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  63.38 
 
 		 214 aa  278  4e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.98 
 
 		 218 aa  274  8e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  64.98 
 
 		 222 aa  274  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 218 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  64.98 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 223 aa  261  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.52 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.98 
 
 		 220 aa  259  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  64.98 
 
 		 217 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  64.98 
 
 		 231 aa  254  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.55 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  63.59 
 
 		 219 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 224 aa  246  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 226 aa  245  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  57.75 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.59 
 
 		 225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 218 aa  228  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.37 
 
 		 235 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  60.37 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  58.99 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.14 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.07 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  58.53 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.61 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 283 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 240 aa  177  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  48.18 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  44.8 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  174  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.73 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 230 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.2 
 
 		 222 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  45.25 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  48.64 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.25 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.36 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  47.11 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1598  response regulator receiver  45.45 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 241 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 224 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  44.09 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0776  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.8 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  45.74 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  45 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  165  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 241 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 225 aa  165  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0655  two component response regulator transcription regulator protein  44.34 
 
 		 228 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.81937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.82 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  49.77 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>