More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2292 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  67.24 
 
 		 860 aa  1137    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 855 aa  912    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  71.41 
 
 		 858 aa  1175    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  72.2 
 
 		 881 aa  1224    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 902 aa  1089    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.14 
 
 		 916 aa  1095    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 		 836 aa  1691    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 876 aa  1170    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  58.02 
 
 		 925 aa  991    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  63.22 
 
 		 885 aa  1061    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 		 903 aa  1129    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 877 aa  1095    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 872 aa  1058    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  67.7 
 
 		 886 aa  1130    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 911 aa  1008    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  68.48 
 
 		 861 aa  1174    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 906 aa  1103    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 		 862 aa  1114    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 		 901 aa  1075    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  62.31 
 
 		 873 aa  1061    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 		 895 aa  1036    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  79.67 
 
 		 845 aa  1338    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  65.22 
 
 		 871 aa  1055    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 894 aa  1065    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  77.07 
 
 		 846 aa  1276    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 864 aa  621  1e-176  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 808 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 802 aa  596  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 896 aa  546  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 928 aa  532  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 877 aa  512  1e-144  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 892 aa  509  1e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 908 aa  511  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 905 aa  501  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 855 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 863 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 		 865 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 864 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 886 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 858 aa  443  1e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 		 809 aa  444  1e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 886 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 886 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 863 aa  438  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 869 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 886 aa  436  1e-120  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  32.97 
 
 		 865 aa  431  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  31.7 
 
 		 865 aa  426  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.65 
 
 		 906 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 799 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  34.56 
 
 		 799 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 799 aa  418  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 799 aa  410  1e-113  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 806 aa  400  9.999999999999999e-111  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 771 aa  395  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 816 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 808 aa  374  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  29.98 
 
 		 893 aa  309  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 881 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  29.04 
 
 		 881 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 881 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 881 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 881 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 881 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 881 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 		 881 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 881 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  28.61 
 
 		 881 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  28.54 
 
 		 881 aa  303  1e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 904 aa  299  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 		 882 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 885 aa  298  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 		 911 aa  297  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1364  valyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 909 aa  295  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.08 
 
 		 883 aa  294  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  29.02 
 
 		 882 aa  294  5e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 		 881 aa  293  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 879 aa  293  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 912 aa  289  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 943 aa  289  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 902 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2982  valyl-tRNA synthetase  28.2 
 
 		 1002 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 883 aa  288  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0705  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 909 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.727948  normal  0.597989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0010  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 		 922 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.885408  hitchhiker  0.00234532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 		 882 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  29 
 
 		 880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  29.93 
 
 		 909 aa  284  4.0000000000000003e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0678  valyl-tRNA synthetase  27.44 
 
 		 909 aa  285  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1241  valyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 879 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 883 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 		 894 aa  283  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  26.16 
 
 		 892 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 872 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 880 aa  282  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  30.29 
 
 		 952 aa  281  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  27.37 
 
 		 909 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 		 877 aa  280  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 		 880 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  30.27 
 
 		 872 aa  280  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.180306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>