More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2286 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  88.58 
 
 		 223 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  82.19 
 
 		 219 aa  355  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  81.02 
 
 		 233 aa  345  3e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  71.89 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  76.81 
 
 		 233 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  73.15 
 
 		 259 aa  305  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  71.76 
 
 		 231 aa  304  7e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  68.35 
 
 		 229 aa  297  7e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  68.35 
 
 		 229 aa  293  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  68.9 
 
 		 217 aa  291  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  66.82 
 
 		 220 aa  291  7e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 		 218 aa  288  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  68.52 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  68.4 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  66.21 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  66.2 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  66.2 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  66.2 
 
 		 222 aa  281  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  64.81 
 
 		 221 aa  270  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  61.01 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  62.8 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  60.39 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  62.96 
 
 		 221 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  59.13 
 
 		 225 aa  264  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  63.24 
 
 		 220 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  57.27 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  57.14 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  56.22 
 
 		 299 aa  243  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  53.1 
 
 		 231 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  50 
 
 		 231 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  55.11 
 
 		 229 aa  217  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  50.23 
 
 		 231 aa  205  4e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  53.6 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  49.52 
 
 		 227 aa  193  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  39.19 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  36.61 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  36.11 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  36.11 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  34.7 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  36.67 
 
 		 223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  32.42 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  34.09 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  31.05 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.67 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  27.73 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  31.05 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  32.08 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  27.03 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  31.34 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  31.42 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  33.04 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  29.38 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.53 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  30.23 
 
 		 443 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 221 aa  95.9  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 		 219 aa  94.7  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 		 630 aa  89.7  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 		 445 aa  89.7  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.73 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  34.4 
 
 		 617 aa  89  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  31.05 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  30.32 
 
 		 450 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  29.68 
 
 		 458 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0187  potassium transporter peripheral membrane component  28.84 
 
 		 465 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.88 
 
 		 445 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 		 628 aa  85.1  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  30.05 
 
 		 444 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 		 450 aa  85.1  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.7 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  30.53 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  30.57 
 
 		 626 aa  82.8  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  31.71 
 
 		 449 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.05 
 
 		 458 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  27.36 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  23.5 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  30 
 
 		 448 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1265  hypothetical protein  27.83 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1198  TrkA domain-containing protein  30.29 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  27.15 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  27.48 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0637  TrkA-N  27.7 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0432302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  26.89 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  29.22 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  28.96 
 
 		 444 aa  79.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  31.36 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 		 443 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  26.89 
 
 		 457 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1400  TrkA-N domain-containing protein  28.38 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0028  potassium transporter peripheral membrane component  25.78 
 
 		 469 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 		 445 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0040  potassium transporter peripheral membrane component  24.89 
 
 		 467 aa  78.2  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  27.57 
 
 		 477 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>