More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2217 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2217  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.335771  normal  0.670692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6567  hydrogen peroxide-inducible genes activator protein  75.64 
 
 
314 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.222143  hitchhiker  0.00672743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4242  transcriptional regulator, LysR family  56.91 
 
 
309 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2291  LysR family transcriptional regulator  53.02 
 
 
320 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11333  normal  0.519031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1919  LysR family transcriptional regulator  53.11 
 
 
314 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.156623  normal  0.456297 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2230  LysR substrate-binding protein  49.83 
 
 
313 aa  222  6e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1816  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 
304 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.78 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2886  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  212  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0434  transcriptional regulator, LysR family  42.72 
 
 
312 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4025  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.55 
 
 
305 aa  210  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.8 
 
 
305 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4079  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.8 
 
 
305 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0119  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.8 
 
 
305 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.985596  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2782  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 
301 aa  208  9e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03200  transcriptional regulator  42.61 
 
 
300 aa  207  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  41.69 
 
 
305 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3788  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.2 
 
 
302 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.48 
 
 
305 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.34 
 
 
302 aa  206  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.34 
 
 
302 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2425  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
308 aa  205  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.540189  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  40.82 
 
 
305 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04591  oxidative stress transcriptional regulator  43.49 
 
 
313 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0687  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 
320 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.366193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2140  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 
303 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.828195  normal  0.0106328 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0036  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0520  hydrogen peroxide-inducible genes activator  41.79 
 
 
311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.454545  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0029  regulatory protein, LysR  42.43 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.242113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1654  hydrogen peroxide-inducible genes activator  41.43 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00724333  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2864  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 
313 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  39.31 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2714  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  39.12 
 
 
302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  38.18 
 
 
302 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2079  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
302 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2323  oxidative stress transcriptional regulator  42.19 
 
 
301 aa  192  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523521  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1798  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 
302 aa  192  6e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.270258  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0693  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0589363  normal  0.107501 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0783  LysR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
311 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.33611  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 
303 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3813  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4222  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
302 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79182  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0640  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0241  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0594299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0871  oxidative stress transcriptional regulator  43.01 
 
 
311 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000180312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0615  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0725  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
319 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1375  LysR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58375  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2661  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
319 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.230449 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2340  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 
313 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0307  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2390  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1778  hydrogen peroxide-inducible genes activator  38.57 
 
 
296 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2576  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1168  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.59 
 
 
319 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1346  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
302 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  37.88 
 
 
296 aa  186  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2941  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
318 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0694604  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2805  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1615  LysR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0196883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2792  LysR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1585  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173107  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0334  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
320 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0362  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 
300 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3324  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.26 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.519513  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3367  oxidative stress regulatory protein  38.26 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0672559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1281  oxidative stress regulatory protein OxyR  37.87 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3358  oxidative stress regulatory protein OxyR  38.26 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5066  transcriptional regulator, LysR family  37.38 
 
 
321 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3406  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 
336 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0334  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 
323 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.937617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0103  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 
318 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3535  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 
323 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.300958  normal  0.425452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3987  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
319 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3211  LysR substrate-binding  39.04 
 
 
323 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.847319  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2690  hydrogen peroxide-inducible genes activator transcription regulator protein  37.16 
 
 
317 aa  179  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196884  normal  0.211159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0711  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 
319 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0312  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1422  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0323  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 
323 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.712215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3681  LysR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
317 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.555356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0224  LysR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
312 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4681  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 
304 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.468795  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1922  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
308 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0631  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
311 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.808562  normal  0.903361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4881  LysR family transcriptional regulator  36.34 
 
 
317 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.635282  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4725  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
304 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>