24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2124 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2124  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  100 
 
 		 294 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00535032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6258  hypothetical protein  52.19 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0456177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3049  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  39.93 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2046  hypothetical protein  39 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3670  hypothetical protein  40.07 
 
 		 326 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0940842  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2684  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  31.74 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.55876  normal  0.318359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2247  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  35.06 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.0131126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5921  hypothetical protein  33.71 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12421  hypothetical protein  29.53 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3859  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.78 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.72846  normal  0.0769538 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1890  putative secreted protein  28.51 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7383  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  34.73 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.882429 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18840  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.81 
 
 		 515 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00867929  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2817  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.37 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3170  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  29.83 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.803624  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1378  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.17 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.365904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0300  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.48 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0657  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.56 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415953  normal  0.211128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1785  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  32.11 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0615189  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3539  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.82 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3476  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.82 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3504  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  30.61 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3489  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiX protein  27.73 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2517  uroporphyrin-III C-methyltransferase  36.27 
 
 		 553 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.459561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>