More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2102 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5683  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  69.96 
 
 
479 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2816  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  73.73 
 
 
475 aa  713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0492392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2762  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  65.89 
 
 
485 aa  655    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16410  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  67.16 
 
 
479 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3598  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.85 
 
 
486 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11872  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.46 
 
 
483 aa  664    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000287104  normal  0.308881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3089  6-phosphogluconate dehydrogenase  65.55 
 
 
489 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.609606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3824  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.77 
 
 
478 aa  669    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.75231  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2102  6-phosphogluconate dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  968    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.157506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4562  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  67.09 
 
 
487 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3359  6-phosphogluconate dehydrogenase  65.97 
 
 
484 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1889  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  66.25 
 
 
483 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0324159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4789  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  66.74 
 
 
486 aa  645    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2812  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.32 
 
 
486 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0746874  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2839  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.32 
 
 
486 aa  661    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3959  6-phosphogluconate dehydrogenase  72.73 
 
 
476 aa  678    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36670  6-phosphogluconate dehydrogenase  69.39 
 
 
484 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26583  normal  0.322334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3445  6-phosphogluconate dehydrogenase  70.34 
 
 
478 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.468283  normal  0.0734674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1729  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  68.75 
 
 
484 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.235564  normal  0.119479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2856  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.32 
 
 
486 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904014  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07950  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.82 
 
 
486 aa  629  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.367535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1524  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  68.96 
 
 
490 aa  627  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0631947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4301  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  64.57 
 
 
480 aa  615  1e-175  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1141  6-phosphogluconate dehydrogenase  66.17 
 
 
479 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1948  6-phosphogluconate dehydrogenase  63.52 
 
 
481 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2449  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  62.26 
 
 
478 aa  610  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1244  6-phosphogluconate dehydrogenase  62.34 
 
 
484 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0180  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  61.49 
 
 
484 aa  596  1e-169  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1061  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  61.57 
 
 
477 aa  597  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.142467  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1596  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  61.22 
 
 
480 aa  592  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.963991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2197  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  62.42 
 
 
478 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000401969 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2279  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.26 
 
 
471 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000283239  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09430  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  61.46 
 
 
520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0326  6-phosphogluconate dehydrogenase  58.42 
 
 
469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1204  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.8 
 
 
468 aa  533  1e-150  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0166  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.3 
 
 
469 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0159  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.52 
 
 
469 aa  530  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0157  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.52 
 
 
469 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0420  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0186  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.52 
 
 
469 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0828  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.742561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0833  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.84 
 
 
490 aa  529  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2376  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0164  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.3 
 
 
469 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0631  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.79 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1798  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2515  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864381  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2210  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.35 
 
 
469 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.828318  normal  0.666462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0469  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
471 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0208  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.52 
 
 
469 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1275  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.56 
 
 
476 aa  526  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.374225  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4715  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.06 
 
 
469 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.246176  decreased coverage  0.00597476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1320  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.37 
 
 
468 aa  525  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0119731  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2847  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.37 
 
 
468 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3014  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.16 
 
 
468 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000146076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1608  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.21 
 
 
468 aa  523  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.222702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1613  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 
468 aa  521  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01931  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1628  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  53.85 
 
 
468 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00766748  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3620  6-phosphogluconate dehydrogenase  56 
 
 
470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2297  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.75 
 
 
490 aa  519  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4459  6-phosphogluconate dehydrogenase  56 
 
 
470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.562999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0642  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.52 
 
 
472 aa  520  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000463294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2962  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.85 
 
 
468 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3907  6-phosphogluconate dehydrogenase  56 
 
 
470 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1031  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01917  hypothetical protein  53.42 
 
 
468 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2320  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3177  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.09 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.635161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2181  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.296225  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2436  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.09 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1202  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.141646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2183  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000119365  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3285  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.58 
 
 
470 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5973  6-phosphogluconate dehydrogenase  54.78 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.882355 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2535  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.09 
 
 
469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4676  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.37 
 
 
470 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0753605  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3801  6-phosphogluconate dehydrogenase  55.37 
 
 
470 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.835565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2420  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.511918  hitchhiker  0.0040278 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00877145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2527  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.92 
 
 
476 aa  509  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.585801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2260  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2206  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.553067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1215  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.77 
 
 
482 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2307  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.42 
 
 
468 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97354  hitchhiker  0.00484467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2642  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.21 
 
 
468 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1582  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.67 
 
 
482 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0292783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2625  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  54.15 
 
 
483 aa  504  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3297  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.87 
 
 
475 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1601  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.48 
 
 
468 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1569  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.48 
 
 
468 aa  503  1e-141  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2309  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.87 
 
 
473 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627768 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2258  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.87 
 
 
473 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0039  6-phosphogluconate dehydrogenase  52.13 
 
 
471 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.554725  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0635  6-phosphogluconate dehydrogenase  53.94 
 
 
484 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4083  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  50.94 
 
 
484 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642645  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1694  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  52.14 
 
 
474 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2404  6-phosphogluconate dehydrogenase  50.74 
 
 
484 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1834  6-phosphogluconate dehydrogenase  51.7 
 
 
473 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylating)  52.33 
 
 
475 aa  497  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.273894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>