More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2085 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 913 aa  1747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  44 
 
 		 919 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 879 aa  498  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  43.57 
 
 		 940 aa  486  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  40.33 
 
 		 917 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 928 aa  446  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  42.13 
 
 		 884 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 938 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 995 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 911 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  38.53 
 
 		 913 aa  426  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  39.98 
 
 		 909 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.53 
 
 		 923 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.64 
 
 		 928 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 		 904 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  38.13 
 
 		 884 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  34.67 
 
 		 925 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 928 aa  352  2e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.42 
 
 		 930 aa  350  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 910 aa  346  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.85 
 
 		 929 aa  344  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 937 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36.81 
 
 		 937 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.83 
 
 		 920 aa  333  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.54 
 
 		 927 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36.28 
 
 		 937 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 929 aa  320  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  36.76 
 
 		 936 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.23 
 
 		 918 aa  301  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.63 
 
 		 913 aa  300  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 		 919 aa  300  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.05 
 
 		 905 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  34.74 
 
 		 903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  36.49 
 
 		 892 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 950 aa  280  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.37 
 
 		 923 aa  274  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.09 
 
 		 922 aa  268  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 835 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  44.63 
 
 		 923 aa  252  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 889 aa  250  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  45.99 
 
 		 940 aa  250  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.92 
 
 		 919 aa  213  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 919 aa  211  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.99 
 
 		 919 aa  211  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.49 
 
 		 915 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.57 
 
 		 955 aa  205  3e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  40.97 
 
 		 934 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  31.03 
 
 		 929 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  40.15 
 
 		 927 aa  201  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.73 
 
 		 916 aa  187  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  30.97 
 
 		 919 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  39.39 
 
 		 961 aa  181  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  30.67 
 
 		 921 aa  177  9e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  35.08 
 
 		 953 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  40.63 
 
 		 1064 aa  150  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 946 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 1000 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  36.01 
 
 		 916 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 		 959 aa  120  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  33.96 
 
 		 977 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  33.15 
 
 		 921 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 921 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.87 
 
 		 921 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  34.1 
 
 		 900 aa  119  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.14 
 
 		 923 aa  116  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  44.92 
 
 		 894 aa  115  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  33.78 
 
 		 240 aa  110  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  31.74 
 
 		 893 aa  96.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 998 aa  95.9  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 		 997 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  34.39 
 
 		 946 aa  90.5  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 897 aa  86.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.93 
 
 		 983 aa  85.9  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 881 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 881 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 876 aa  84.3  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 		 992 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.62 
 
 		 947 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 951 aa  82.4  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  28.75 
 
 		 948 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  44.34 
 
 		 953 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  33.71 
 
 		 998 aa  79.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  47.06 
 
 		 956 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 952 aa  77  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 927 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  30.65 
 
 		 1163 aa  75.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  32.47 
 
 		 1052 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.17 
 
 		 1029 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  27.93 
 
 		 918 aa  74.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  39.09 
 
 		 862 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.81 
 
 		 1150 aa  72.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 981 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.7 
 
 		 1118 aa  71.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.2 
 
 		 1422 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 680 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 877 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  28.25 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  30.05 
 
 		 1123 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>