More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2054 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2054  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  836    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  76.67 
 
 		 421 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2121  histidyl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 421 aa  558  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2365  histidyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 420 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 420 aa  514  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1701  histidyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 		 421 aa  478  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0751975  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12600  histidyl-tRNA synthetase  59.62 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0797227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3809  histidyl-tRNA synthetase  59.13 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.985695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2590  histidyl-tRNA synthetase  61 
 
 		 422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108947  normal  0.309926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1950  histidyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3356  histidyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00613181  normal  0.200159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2311  histidyl-tRNA synthetase  57.46 
 
 		 421 aa  450  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.202906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2324  histidyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0514444  normal  0.0262983 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2285  histidyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2332  histidyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 418 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170172 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 424 aa  382  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3015  histidyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 419 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0595  histidyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 457 aa  354  1e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.736305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 420 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 		 413 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 421 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  44.23 
 
 		 422 aa  346  4e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 464 aa  344  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 413 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 416 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  342  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 419 aa  339  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0006  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 418 aa  335  7.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.14648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 416 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04430  histidyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.693263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_6  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 420 aa  331  1e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 415 aa  330  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 420 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  43.47 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 429 aa  326  5e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 429 aa  325  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 429 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 429 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 428 aa  322  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 420 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 450 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 422 aa  319  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 427 aa  318  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 424 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>