More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2047 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
876 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
876 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
859 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
875 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4474  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
874 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.41358  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 
880 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.48 
 
 
867 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
876 aa  682    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
884 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
905 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
904 aa  840    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
874 aa  637    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
874 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
931 aa  643    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
874 aa  651    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
874 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
888 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
876 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
892 aa  1028    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  68.17 
 
 
889 aa  1185    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
874 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
876 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
880 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 
875 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
880 aa  687    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1441  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
897 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0440336  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
882 aa  667    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
897 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
876 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
880 aa  650    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
864 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3238  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
875 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000222674  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
876 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
892 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
867 aa  649    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
881 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
874 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3373  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
875 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0247326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  61.84 
 
 
881 aa  1009    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 
898 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 
893 aa  1004    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0898  alanyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
875 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000010723  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 
875 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
876 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
874 aa  649    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
856 aa  645    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
874 aa  678    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 
892 aa  1019    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
874 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
868 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
874 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 
892 aa  1035    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
884 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
880 aa  654    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
863 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
897 aa  683    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
897 aa  853    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
874 aa  681    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
876 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
878 aa  661    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
874 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  687    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
874 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
883 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
874 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
874 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
869 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
874 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
874 aa  646    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
876 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
874 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
874 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
878 aa  704    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
876 aa  662    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 
876 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
874 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
892 aa  921    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  44 
 
 
897 aa  683    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
863 aa  664    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
878 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 
876 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
886 aa  1049    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 
878 aa  668    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 
893 aa  843    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 
896 aa  1019    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 
900 aa  640    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
897 aa  853    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
897 aa  851    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
898 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
876 aa  640    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
879 aa  649    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
876 aa  664    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 
877 aa  673    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>