More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2033 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  60.61 
 
 		 287 aa  305  4.0000000000000004e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  36.63 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  41.86 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 151 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 		 177 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  36.29 
 
 		 143 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  38.35 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  44.25 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  37.96 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 149 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 146 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 140 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 195 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  38.84 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 139 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 171 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  37.4 
 
 		 168 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0283  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.34751  hitchhiker  0.000254243 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  38.32 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  43 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 139 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  43 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  42.28 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 142 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 167 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 164 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 201 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 159 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  33.09 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2841  transcriptional regulator, MarR family  40.65 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.02 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  47.67 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4315  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6003  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  31.76 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  45.35 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4084  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0692551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  36.17 
 
 		 168 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.62 
 
 		 155 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 184 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 158 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  31.21 
 
 		 149 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3088  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00891754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  38.89 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  48.75 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  43.08 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 159 aa  57  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>