More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2032 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
551 aa  1119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  72.74 
 
 
553 aa  826  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  52.72 
 
 
584 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  51.06 
 
 
582 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  50.18 
 
 
591 aa  547  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  50.62 
 
 
601 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  50.45 
 
 
587 aa  539  1e-152  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 
570 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  50.98 
 
 
602 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  48.31 
 
 
590 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  47.42 
 
 
583 aa  482  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 
574 aa  425  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1650  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
571 aa  408  1e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67945  normal  0.887385 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0489  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
569 aa  385  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248205  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0681  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 
570 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.577585  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 
565 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 
578 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 
521 aa  332  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3492  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 
555 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
512 aa  323  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
499 aa  320  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 
525 aa  317  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 
516 aa  316  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 
566 aa  315  1e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01100  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.48 
 
 
644 aa  315  2e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
527 aa  314  2e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
557 aa  313  3e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
499 aa  311  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 
509 aa  310  6e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.87 
 
 
513 aa  308  2e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  42.31 
 
 
490 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 
549 aa  306  5e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.62 
 
 
561 aa  305  1e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
539 aa  303  5e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 
561 aa  303  6e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.66 
 
 
561 aa  303  7e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 
582 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
520 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  38.77 
 
 
562 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 
563 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
518 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.18 
 
 
563 aa  299  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 
557 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 
501 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 
536 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.85 
 
 
561 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 
514 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
591 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  38.14 
 
 
557 aa  296  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.5 
 
 
561 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.24 
 
 
582 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  38.57 
 
 
557 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
563 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  34.97 
 
 
518 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.36 
 
 
563 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.21 
 
 
515 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
590 aa  294  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.24 
 
 
529 aa  294  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 
508 aa  293  6e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 
510 aa  293  7e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 
662 aa  293  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
559 aa  292  1e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 
519 aa  291  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  39.3 
 
 
514 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
518 aa  291  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
515 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  38.14 
 
 
520 aa  290  5e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  36.18 
 
 
496 aa  290  5e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  36.18 
 
 
496 aa  290  5e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  35.86 
 
 
496 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41031e-13 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
546 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  3.08481e-07 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 
500 aa  288  3e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.49 
 
 
544 aa  287  3e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 
508 aa  287  3e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  37.21 
 
 
518 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.82 
 
 
579 aa  286  6e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
561 aa  286  7e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 
532 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
520 aa  285  1e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 
770 aa  284  2e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
544 aa  284  2e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  38.59 
 
 
503 aa  285  2e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
522 aa  284  2e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  36.2 
 
 
517 aa  284  3e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
584 aa  284  3e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
508 aa  283  4e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 
527 aa  283  4e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 
505 aa  284  4e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  35.63 
 
 
522 aa  283  6e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
525 aa  283  7e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  39.36 
 
 
526 aa  283  7e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  35.39 
 
 
496 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.33 
 
 
556 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.33 
 
 
556 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.33 
 
 
556 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  35.02 
 
 
576 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
509 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  36.58 
 
 
561 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 
565 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 
564 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  4.16298e-08 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>