More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1991 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  79.3 
 
 
261 aa  427  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  78.17 
 
 
265 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  74.81 
 
 
258 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  73.52 
 
 
261 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  70.63 
 
 
687 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  69.53 
 
 
263 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45528e-05 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  69.26 
 
 
261 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  69.14 
 
 
263 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  68.4 
 
 
261 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  67.95 
 
 
260 aa  362  4e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  67.6 
 
 
261 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  64.73 
 
 
287 aa  359  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  67.95 
 
 
263 aa  357  1e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  67.86 
 
 
262 aa  356  2e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  68.11 
 
 
264 aa  351  6e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  67.89 
 
 
260 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2169  triosephosphate isomerase  65.89 
 
 
265 aa  350  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.154658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2532  triosephosphate isomerase  65.75 
 
 
264 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2705  triosephosphate isomerase  69.92 
 
 
261 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  66.67 
 
 
261 aa  346  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2406  triosephosphate isomerase  68.27 
 
 
261 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2446  triosephosphate isomerase  68.27 
 
 
261 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2452  triosephosphate isomerase  68.27 
 
 
261 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.487817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  65.48 
 
 
261 aa  345  6e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  9.7423e-09  hitchhiker  9.94621e-06 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  64.31 
 
 
271 aa  344  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  63.53 
 
 
271 aa  342  3e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.36952e-07 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11466  triosephosphate isomerase  67.2 
 
 
261 aa  341  7e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.35283e-12  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  63.24 
 
 
270 aa  338  5e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  64.57 
 
 
264 aa  338  6e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  64.68 
 
 
258 aa  331  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  65.35 
 
 
260 aa  329  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  66.01 
 
 
308 aa  328  5e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11370  triosephosphate isomerase  64.84 
 
 
263 aa  326  2e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.413237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2929  Triose-phosphate isomerase  62.65 
 
 
261 aa  318  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  59.92 
 
 
263 aa  315  4e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0907  triose-phosphate isomerase  54.33 
 
 
265 aa  279  4e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  50 
 
 
267 aa  271  6e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
248 aa  257  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  52.16 
 
 
250 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.2 
 
 
257 aa  247  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  51 
 
 
250 aa  243  2e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
250 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
248 aa  240  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 
255 aa  239  3e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
249 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.18 
 
 
256 aa  235  5e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 
248 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  48.02 
 
 
248 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
254 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
252 aa  232  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  47.06 
 
 
251 aa  231  7e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  48.21 
 
 
257 aa  231  8e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.77 
 
 
249 aa  230  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 
252 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 
250 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 
256 aa  228  6e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  5.44988e-07 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  51.19 
 
 
254 aa  228  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  45.49 
 
 
255 aa  228  7e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  46.51 
 
 
260 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.92621e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
253 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.67 
 
 
655 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.22 
 
 
256 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 
251 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 
260 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  46.51 
 
 
260 aa  225  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  49.41 
 
 
251 aa  224  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.78614e-07  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.83 
 
 
253 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 
260 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.37173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  45.74 
 
 
254 aa  223  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  6.72651e-05  hitchhiker  5.21404e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  3.71764e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.21721e-05  unclonable  5.28037e-12 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.57421e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  49 
 
 
250 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  8.4878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
260 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  8.76569e-08  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
252 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.54673e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  48.58 
 
 
254 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  43.75 
 
 
252 aa  221  6e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  44.96 
 
 
260 aa  221  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.64415e-05  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  48.02 
 
 
250 aa  221  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
249 aa  221  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 
250 aa  220  1e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 
251 aa  221  1e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  2.74179e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 
251 aa  220  2e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  2.15074e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  46.46 
 
 
251 aa  220  2e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.60979e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  44.96 
 
 
260 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  4.2953e-06  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.24 
 
 
650 aa  219  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 
253 aa  219  4e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 
260 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  4.96067e-06 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 
251 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  2.93066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 
252 aa  217  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 
250 aa  217  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  44.62 
 
 
250 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  45.67 
 
 
251 aa  216  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 
253 aa  215  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>