107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1844 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  100 
 
 		 286 aa  563  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  76.14 
 
 		 295 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  76.54 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  65.56 
 
 		 299 aa  361  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  65.77 
 
 		 351 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  61.96 
 
 		 303 aa  341  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  62.84 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  58.67 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  62.5 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  57.2 
 
 		 297 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  61.39 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  59.07 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  61.66 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  58.91 
 
 		 273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  61.81 
 
 		 302 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  58.82 
 
 		 267 aa  308  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  58.53 
 
 		 280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  63.22 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  61.45 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  55.14 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  56.03 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  53.78 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  55.51 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  55.51 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  55.51 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  54.37 
 
 		 304 aa  261  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  52.85 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  51.31 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  51.6 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  45.21 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  35.2 
 
 		 259 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  31.7 
 
 		 366 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 1019 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4397  hypothetical protein  26.82 
 
 		 615 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.272271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  32.95 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2712  hypothetical protein  27.76 
 
 		 543 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000442298  hitchhiker  0.0000400817 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.24 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8396  hypothetical protein  29.09 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.75052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4258  hypothetical protein  29.96 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  30.56 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06610  RecB family exonuclease  28.15 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 		 1016 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0308  exonuclease-like protein  26.82 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000290112  hitchhiker  0.00000170332 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2998  hypothetical protein  29.11 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  29.81 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  31.01 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1197  hypothetical protein  32.29 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0561644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2601  hypothetical protein  31.68 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.718705  normal  0.128689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0821  hypothetical protein  26.52 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000666708  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  25 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 781 aa  62  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0825  hypothetical protein  31.13 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0799374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1024  hypothetical protein  31.37 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  27.69 
 
 		 1044 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  20.68 
 
 		 803 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0777  hypothetical protein  29.92 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0715  hypothetical protein  31.01 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0903  hypothetical protein  31.01 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5824  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 1052 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.101502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  35.62 
 
 		 988 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  23.62 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  24.42 
 
 		 781 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.19 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  27.86 
 
 		 1055 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  26.12 
 
 		 1059 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  28.11 
 
 		 1101 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0952  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  52.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 1038 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3814  hypothetical protein  32 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18541  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1291  hypothetical protein  21.08 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  23.83 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1061 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0202  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 		 1159 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 1038 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 1051 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1263  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.217643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  27.41 
 
 		 977 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1466  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 1051 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  31.9 
 
 		 991 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1265  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.454747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  33.71 
 
 		 958 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  29.93 
 
 		 1052 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1052 aa  46.2  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  32.54 
 
 		 984 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1395  hypothetical protein  21.63 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3915  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.33 
 
 		 1048 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1535  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  26.6 
 
 		 779 aa  44.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  25.39 
 
 		 783 aa  44.3  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1299  hypothetical protein  20.44 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0504413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1429  hypothetical protein  20.89 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0896  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 		 1066 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.380602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  30.06 
 
 		 1059 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  30.15 
 
 		 1111 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  26.14 
 
 		 957 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>