132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1801 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
448 aa  876    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  64.38 
 
 
451 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  62.83 
 
 
460 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  56.92 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  56.95 
 
 
453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  56.72 
 
 
453 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  55.81 
 
 
450 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  51.46 
 
 
442 aa  404  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  48.17 
 
 
572 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 
469 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  46.15 
 
 
474 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  54.43 
 
 
464 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  52.74 
 
 
464 aa  362  8e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
469 aa  350  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  45.63 
 
 
462 aa  346  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  45.87 
 
 
458 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  41.92 
 
 
465 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  47.4 
 
 
458 aa  312  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 
439 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  38.03 
 
 
440 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  32.21 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 
421 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
454 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  40.36 
 
 
439 aa  209  6e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  28.93 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  28.29 
 
 
443 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  29.62 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
426 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  33.82 
 
 
436 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  29.51 
 
 
408 aa  176  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  29.74 
 
 
441 aa  176  6e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  31.53 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  31.29 
 
 
427 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  31.06 
 
 
427 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  30.37 
 
 
427 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  31.9 
 
 
427 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  31.53 
 
 
427 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  31.53 
 
 
427 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  31.53 
 
 
427 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  31.53 
 
 
427 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  30.49 
 
 
416 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  31.53 
 
 
427 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
419 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  31.53 
 
 
427 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  38.99 
 
 
454 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  25.93 
 
 
439 aa  164  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
421 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  30.09 
 
 
425 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
451 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  28.76 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  27.8 
 
 
425 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  29.38 
 
 
447 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  28.12 
 
 
435 aa  150  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
462 aa  150  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  26.68 
 
 
458 aa  150  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  28.54 
 
 
460 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  28.27 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  27.8 
 
 
424 aa  143  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  30.68 
 
 
426 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  29.15 
 
 
430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 
456 aa  134  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  28.85 
 
 
460 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
462 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
472 aa  130  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
462 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  28.08 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
433 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  27.51 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  27.54 
 
 
462 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07437  Autophagy-related protein 22-1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW93]  23.76 
 
 
588 aa  123  8e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0083743  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2368  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
445 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.854492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  27.27 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18980  major facilitator superfamily permease  29.79 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.273601  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  26.72 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  27.07 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3421  major facilitator transporter  29.47 
 
 
466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0574  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
440 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  28.99 
 
 
436 aa  117  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  27.01 
 
 
426 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  26.73 
 
 
449 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  27.79 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  27.43 
 
 
493 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  26.6 
 
 
466 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  27.86 
 
 
469 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  26.6 
 
 
467 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  24.62 
 
 
454 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3637  major facilitator transporter  27.38 
 
 
454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3710  major facilitator superfamily transporter  27.38 
 
 
454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.417195  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3642  major facilitator transporter  27.38 
 
 
454 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.266137  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  26.7 
 
 
449 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  23.12 
 
 
593 aa  100  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>