126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1753 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1753  TrkA-C domain-containing protein  100 
 
 		 160 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0083  TrkA-C domain protein  73.12 
 
 		 160 aa  235  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2648  TrkA-C domain-containing protein  64.38 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.508711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1892  TrkA-like  60 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30896  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2224  TrkA domain-containing protein  58.75 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0366683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4656  TrkA domain-containing protein  58.13 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3881  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  60.62 
 
 		 160 aa  180  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.122887 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0917  TrkA-C domain protein  55.62 
 
 		 166 aa  170  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0119  TrkA domain-containing protein  53.8 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000259945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0407  TrkA-C domain protein  50.96 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0120  TrkA domain-containing protein  53.16 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13266  hypothetical protein  47.5 
 
 		 160 aa  146  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.36892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1613  TrkA-C domain protein  46.88 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.634302  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2863  TrkA-C  48.12 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2907  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.486572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2893  TrkA domain-containing protein  48.12 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2652  TrkA-C domain protein  49.01 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000569154  decreased coverage  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3875  TrkA domain-containing protein  44.38 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1157  TrkA-C  43.67 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3662  TrkA-C domain protein  43.12 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19010  predicted regulatory ligand binding protein, C-terminal domain of K+ channels like protein  46.5 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.990404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2801  TrkA-C domain protein  44.3 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1554  TrkA-C domain protein  34.18 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686318  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2066  TrkA-C  29.19 
 
 		 163 aa  87.8  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1517  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3238  TrkA-C domain protein  28.93 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.574158 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0860  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4776  potassium channel, C-terminus  28.67 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0093582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4757  hypothetical protein  28.67 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.572942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4872  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0357705  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5157  trkA domain protein  28.67 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.09944e-23 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0233  TrkA-C domain protein  27.21 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5188  TrkA domain-containing protein  27.81 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4912  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5287  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5202  trkA domain protein  28 
 
 		 165 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.137218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5194  trkA domain protein  28 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0055  trkA domain protein  28 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0095258  hitchhiker  0.00000000899247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4573  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4878  trkA domain protein  26.83 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4640  TrkA domain-containing protein  26.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4475  potasium uptake protein  26.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4493  potasium uptake protein  26.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4994  TrkA domain-containing protein  26.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4854  trkA domain protein  27.03 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0383  trkA domain protein  27.03 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4864  trkA domain protein  26.85 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4885  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0407  TrkA-C domain protein  31.97 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3109  TrkA-C domain protein  28.39 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0085  Putative regulatory ligand-binding protein related to C-terminal domains of K+ channels-like protein  40.74 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0362  TrkA-C domain protein  30.67 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.541071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  41.67 
 
 		 673 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  52.63 
 
 		 671 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2191  TrkA-C domain protein  23.7 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  44.74 
 
 		 662 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  30.59 
 
 		 674 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0799  TrkA-C domain protein  28.4 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.6922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1208  TrkA-C domain protein  24.83 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0323117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0601  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0579  hypothetical protein  36.05 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0206  TrkA domain-containing protein  27.52 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  38.81 
 
 		 672 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6030  hypothetical protein  34.88 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176794  normal  0.984792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.82 
 
 		 697 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1338  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  42.37 
 
 		 664 aa  51.2  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  32.89 
 
 		 668 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1200  TrkA domain-containing protein  27.66 
 
 		 212 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.228424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  32.31 
 
 		 671 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.04 
 
 		 350 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  38.24 
 
 		 542 aa  48.5  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  34.18 
 
 		 684 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  40.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 		 667 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.9 
 
 		 233 aa  47.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  40.68 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  32.88 
 
 		 693 aa  47.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 341 aa  47.4  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1361  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00515151  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0356  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  38.98 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000338081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 666 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1691  TrkA-C domain protein  26.96 
 
 		 401 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1615  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0410032  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1614  sodium/hydrogen exchanger  41.27 
 
 		 710 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.051901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  32.84 
 
 		 666 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 		 652 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 335 aa  45.1  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0062  putative potassium/proton antiporter  36.51 
 
 		 720 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000657168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  33.9 
 
 		 221 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  33.9 
 
 		 221 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>