More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1731 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  729  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.28 
 
 
313 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  45.83 
 
 
289 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  38.66 
 
 
334 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 
309 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
326 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  38.08 
 
 
310 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  40.07 
 
 
364 aa  142  1e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  34.84 
 
 
311 aa  134  4e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  36.3 
 
 
335 aa  132  8e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  35.1 
 
 
314 aa  132  1e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  36.62 
 
 
298 aa  130  5e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  36.36 
 
 
308 aa  129  9e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  36.04 
 
 
308 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  36.04 
 
 
308 aa  128  2e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  41.38 
 
 
356 aa  127  2e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 
330 aa  127  4e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  3.22546e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  36.21 
 
 
308 aa  126  8e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 
310 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.71 
 
 
304 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  33.89 
 
 
314 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  36.3 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.13 
 
 
320 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  36.3 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  37.66 
 
 
302 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  38.16 
 
 
312 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  32.19 
 
 
319 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.81 
 
 
312 aa  121  2e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
310 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  28.96 
 
 
302 aa  120  4e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  37.21 
 
 
310 aa  120  4e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  37.21 
 
 
310 aa  120  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  37.21 
 
 
310 aa  120  4e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  37.21 
 
 
310 aa  120  5e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  37.21 
 
 
310 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  37.21 
 
 
310 aa  119  8e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  34.2 
 
 
298 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4446  hypothetical protein  32.43 
 
 
311 aa  115  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.602147  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  34.01 
 
 
304 aa  114  2e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  34 
 
 
302 aa  113  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  33.55 
 
 
310 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  31.73 
 
 
304 aa  112  8e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3207  hypothetical protein  32.43 
 
 
305 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  33.44 
 
 
300 aa  112  1e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  35.36 
 
 
301 aa  112  1e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4953  hypothetical protein  32.43 
 
 
305 aa  112  1e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  34.93 
 
 
307 aa  112  2e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  33.79 
 
 
319 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  33.81 
 
 
294 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.6 
 
 
319 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  36.17 
 
 
298 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  35.62 
 
 
316 aa  106  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.45 
 
 
321 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  34.87 
 
 
310 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
301 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  35.9 
 
 
321 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  32.67 
 
 
310 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  33.55 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.84 
 
 
295 aa  103  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.95 
 
 
300 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
307 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
301 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  33.21 
 
 
290 aa  100  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 
308 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  32.42 
 
 
324 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  32.75 
 
 
295 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  34.45 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  28.52 
 
 
303 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
290 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  32.64 
 
 
322 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  28.57 
 
 
297 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  31.58 
 
 
311 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  32.89 
 
 
308 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  27.72 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  30.43 
 
 
301 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  32.23 
 
 
317 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  35.09 
 
 
297 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  31.54 
 
 
297 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.16 
 
 
303 aa  93.2  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  29.39 
 
 
290 aa  92.8  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.93 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  31.86 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.89 
 
 
324 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  32.26 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.95 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2925  protein of unknown function DUF6, transmembrane  32.53 
 
 
304 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.44 
 
 
297 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.463759  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  34.49 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.49 
 
 
300 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.11 
 
 
324 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.34 
 
 
291 aa  88.6  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.67 
 
 
324 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  32.35 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  32.23 
 
 
291 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
305 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 
305 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  28.31 
 
 
305 aa  85.9  1e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 
304 aa  84.3  3e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>