More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1621 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1621  ABC transporter-like protein  100 
 
 
266 aa  534  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76125  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0336  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  73.08 
 
 
273 aa  400  1e-110  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  73.46 
 
 
330 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5053  ABC transporter related  73.66 
 
 
271 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2204  ABC transporter related protein  72.97 
 
 
271 aa  387  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.166445  hitchhiker  0.000194766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02590  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  72.8 
 
 
302 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1239  ABC transporter related  71.21 
 
 
292 aa  381  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.469823  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  68.2 
 
 
271 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  5.06205e-09 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4300  ABC transporter related  71.15 
 
 
303 aa  371  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  decreased coverage  1.86519e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0358  ABC transporter related protein  73.08 
 
 
267 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2691  ABC transporter related protein  73.44 
 
 
271 aa  364  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.0790399 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37300  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  67.58 
 
 
290 aa  362  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1448  ABC transporter related protein  66.92 
 
 
264 aa  360  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.425565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  64.64 
 
 
275 aa  354  9e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  67.18 
 
 
265 aa  352  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2555  ABC transporter related  68.32 
 
 
269 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.040458  normal  0.702265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  67.44 
 
 
265 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3047  ABC transporter related  65.25 
 
 
292 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2744  ABC transporter related  67.55 
 
 
269 aa  342  3e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0180142  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  62.93 
 
 
279 aa  340  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  65.88 
 
 
267 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  65.87 
 
 
286 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  64.34 
 
 
276 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1120  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.46 
 
 
266 aa  339  3e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.721216  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1803  ABC transporter related  64.2 
 
 
267 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 
264 aa  331  7e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 
264 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 
264 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 
264 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  63.08 
 
 
264 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
271 aa  329  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2746  ABC transporter related protein  64.98 
 
 
266 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425964  normal  0.919732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.55 
 
 
271 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06500  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  62.99 
 
 
283 aa  327  2e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  62.16 
 
 
271 aa  325  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4085  ABC transporter related  66.27 
 
 
264 aa  325  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0156292  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  61.87 
 
 
260 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5334  ABC transporter related protein  58.12 
 
 
285 aa  322  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  61.42 
 
 
258 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  61.48 
 
 
263 aa  318  8e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3068  enterobactin-iron transport system ATP-binding protein  57.81 
 
 
269 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2720  ABC transporter related  61.09 
 
 
261 aa  310  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.250135  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10180  ferric enterobactin transport protein FepC  65.22 
 
 
265 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0235385  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3465  ABC transporter related protein  61.83 
 
 
277 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  hitchhiker  0.00205843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0646  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
270 aa  308  7e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  59.61 
 
 
282 aa  307  1e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2927  ABC transporter related protein  58.04 
 
 
260 aa  307  1e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5111  ABC transporter related protein  62.45 
 
 
262 aa  306  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  57.92 
 
 
277 aa  305  7e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  54.9 
 
 
269 aa  304  1e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  56.93 
 
 
271 aa  301  6e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  54.51 
 
 
269 aa  301  8e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  56.76 
 
 
271 aa  300  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  58.08 
 
 
274 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  57.48 
 
 
293 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  57.65 
 
 
299 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2416  ABC transporter related  53.91 
 
 
273 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.118562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1628  ABC transporter related  60.69 
 
 
268 aa  296  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0337589  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1737  ABC transporter related  56.45 
 
 
284 aa  295  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0324533  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5746  ABC transporter related  52.69 
 
 
264 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  54.15 
 
 
269 aa  294  8e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  58.2 
 
 
257 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  55.82 
 
 
278 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3334  hypothetical protein  55.47 
 
 
267 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.435313  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2088  ABC transporter related  54.02 
 
 
267 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  9.43272e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3732  ABC transporter related  58.17 
 
 
270 aa  288  9e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  54.17 
 
 
625 aa  287  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2061  ABC transporter related  48.46 
 
 
277 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.948125 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2267  ABC transporter related protein  57.09 
 
 
270 aa  285  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2444  ferric enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein FepC  54.65 
 
 
272 aa  284  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3186  ferric enterobactin ABC transporter ATP-binding protein FepC  54.65 
 
 
272 aa  284  1e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0584724 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2543  ABC transporter related  54.65 
 
 
272 aa  284  1e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7988  ABC transporter related protein  58.3 
 
 
260 aa  283  2e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34701  normal  0.255367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3783  ABC transporter related protein  59.69 
 
 
266 aa  282  4e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2824  ABC transporter related  55.12 
 
 
278 aa  282  5e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  51.92 
 
 
273 aa  281  6e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.16 
 
 
273 aa  281  7e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  52.16 
 
 
273 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  278  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  279  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  278  5e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  278  5e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  51.76 
 
 
273 aa  278  5e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  51.37 
 
 
273 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.22967e-24 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4293  ABC transporter related  56.52 
 
 
280 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3525  ABC transporter related  56.54 
 
 
287 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1984  ABC transporter related  54.79 
 
 
271 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.76554e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2593  ABC transporter  54.62 
 
 
263 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295481  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  50.99 
 
 
265 aa  275  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2667  ABC transporter related  50.96 
 
 
281 aa  273  1e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0416  ABC transporter related  54.62 
 
 
284 aa  274  1e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  48.82 
 
 
264 aa  272  4e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2937  ABC transporter related protein  49.43 
 
 
284 aa  272  5e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>