More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1614 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 509 aa  1040    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  54.37 
 
 		 501 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  54.69 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  49.04 
 
 		 529 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 		 499 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  43.89 
 
 		 516 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 518 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.75 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.75 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  44.75 
 
 		 517 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  45.04 
 
 		 525 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  42.17 
 
 		 508 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 508 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 515 aa  369  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  41.25 
 
 		 505 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  44.06 
 
 		 620 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  38.28 
 
 		 496 aa  352  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  37.27 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  37.27 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 496 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  41.41 
 
 		 530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 511 aa  336  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  39.8 
 
 		 503 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  40.56 
 
 		 527 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 		 1043 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 526 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.06 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.06 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.06 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 554 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 521 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.61 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.29 
 
 		 524 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 540 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37 
 
 		 492 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 516 aa  326  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  43.14 
 
 		 534 aa  326  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 517 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 530 aa  322  9.000000000000001e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.76 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.25 
 
 		 513 aa  319  6e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.99 
 
 		 504 aa  319  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.8 
 
 		 570 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 513 aa  318  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  38.41 
 
 		 662 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 516 aa  317  5e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 525 aa  316  5e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  41.16 
 
 		 502 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  41.16 
 
 		 502 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  41.16 
 
 		 502 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  40.16 
 
 		 521 aa  316  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 515 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  37.6 
 
 		 522 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.67 
 
 		 525 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 526 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  41.32 
 
 		 508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  40.41 
 
 		 506 aa  314  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 512 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 534 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.52 
 
 		 533 aa  313  5.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  37.7 
 
 		 565 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.25 
 
 		 514 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.68 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 523 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.76 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.91 
 
 		 530 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 534 aa  310  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 579 aa  310  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 502 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 531 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  41.26 
 
 		 553 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 		 532 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 530 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 515 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 		 499 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.3 
 
 		 510 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 		 525 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 520 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 510 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>