More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1599 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2382  peptide ABC transporter  69.93 
 
 
560 aa  761  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1599  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
535 aa  1082  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.525219 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6565  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
546 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0953437  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6171  4-phytase  45.58 
 
 
546 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1266  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 
546 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.335203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3479  extracellular solute-binding protein  39.8 
 
 
546 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116614  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
555 aa  344  2e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3479  extracellular solute-binding protein family 5  37.11 
 
 
541 aa  316  7e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  38.04 
 
 
542 aa  315  2e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0428  extracellular solute-binding protein family 5  35.51 
 
 
537 aa  314  3e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2115  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
511 aa  312  8e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.435863  normal  0.188347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0507  extracellular solute-binding protein family 5  35.78 
 
 
537 aa  308  1e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12220  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  36.07 
 
 
550 aa  283  5e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  35.7 
 
 
551 aa  274  2e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0241  extracellular solute-binding protein family 5  34.57 
 
 
551 aa  245  1e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.161576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3498  extracellular solute-binding protein family 5  35.69 
 
 
560 aa  238  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.716688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0939  extracellular solute-binding protein family 5  32.87 
 
 
532 aa  220  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2530  putative ABC transporter  32.32 
 
 
553 aa  214  4e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2173  extracellular solute-binding protein family 5  34.92 
 
 
544 aa  209  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 
535 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34390  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.49 
 
 
542 aa  203  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256824  normal  0.563037 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0031  extracellular solute-binding protein family 5  31.47 
 
 
547 aa  193  8e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.255435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
521 aa  191  3e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7175  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.25 
 
 
543 aa  191  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
521 aa  191  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
521 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.27 
 
 
521 aa  191  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.27 
 
 
521 aa  191  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0753  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
490 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.139724  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5184  ABC-type transporter, substrate binding protein  29.48 
 
 
550 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.532866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
564 aa  186  8e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0295  extracellular solute-binding protein family 5  26.68 
 
 
558 aa  186  1e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.83 
 
 
562 aa  186  1e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24440  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
601 aa  186  1e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3223  ABC transporter, periplasmic binding protein  31.09 
 
 
539 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680403  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4174  extracellular solute-binding protein family 5  29.37 
 
 
545 aa  183  7e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 
495 aa  181  3e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
519 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3755  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
557 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18670  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
587 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2958  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
543 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4456  extracellular solute-binding protein family 5  28.91 
 
 
545 aa  178  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3088  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein, putative  29.31 
 
 
542 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4320  extracellular solute-binding protein family 5  30.1 
 
 
554 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  31.64 
 
 
520 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0033  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
547 aa  176  1e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1057  extracellular solute-binding protein  30 
 
 
557 aa  176  1e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 
493 aa  174  2e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  26.43 
 
 
502 aa  173  7e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  31.13 
 
 
531 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4854  putative ABC transporter (substrate binding protein)  31.9 
 
 
554 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4832  putative ABC transporter (substrate binding protein)  28.6 
 
 
551 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264059  normal  0.92248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  33.24 
 
 
554 aa  171  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0273  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  31.26 
 
 
525 aa  170  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  31.3 
 
 
514 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
607 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.47 
 
 
510 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  31.15 
 
 
509 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 
526 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  27.58 
 
 
524 aa  167  6e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1779  extracellular solute-binding protein family 5  29.68 
 
 
547 aa  166  1e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79401e-13 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  29.09 
 
 
521 aa  165  2e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3157  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
541 aa  165  2e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.821676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0365  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 
517 aa  164  4e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0146  extracellular solute-binding protein family 5  29.59 
 
 
513 aa  164  4e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.21 
 
 
516 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 
518 aa  163  8e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.2 
 
 
505 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0754  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  28.83 
 
 
526 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0804  nickel ABC transporter, nickel-binding protein, putative  28.83 
 
 
526 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
513 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 
534 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6651  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 
498 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45162  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48060  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
525 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2311  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 
562 aa  159  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34367  normal  0.0804809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.57 
 
 
513 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 
527 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.05 
 
 
512 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
521 aa  156  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.11 
 
 
512 aa  156  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.11 
 
 
512 aa  156  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2626  extracellular solute-binding protein family 5  29.36 
 
 
503 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.253128  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3243  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 
509 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.649697  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.92 
 
 
512 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.14 
 
 
535 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
505 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.66 
 
 
508 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6076  nickel ABC transporter, periplasmic nickel-binding protein  30.13 
 
 
524 aa  154  3e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.814144  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  26.58 
 
 
517 aa  155  3e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.92 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.92 
 
 
512 aa  154  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0542  extracellular solute-binding protein family 5  27.03 
 
 
537 aa  154  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578152 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.92 
 
 
512 aa  153  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2033  nickel ABC transporter, periplasmic nickel- binding protein  27.7 
 
 
530 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.06 
 
 
532 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2850  putative ABC transporter substrate-binding protein  30 
 
 
490 aa  153  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.938621  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2795  extracellular solute-binding protein family 5  31.78 
 
 
499 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.730452 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
512 aa  151  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.91 
 
 
493 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2482  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
582 aa  151  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0259131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>