261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1597 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1597  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0261  hypothetical protein  70.81 
 
 
347 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1628  hypothetical protein  63.09 
 
 
442 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0495232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5030  hypothetical protein  69.47 
 
 
391 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.995412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0719  hypothetical protein  63.69 
 
 
379 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3197  hypothetical protein  41.69 
 
 
569 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3720  hypothetical protein  38.59 
 
 
416 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117489  normal  0.0352204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0563  hypothetical protein  39.49 
 
 
421 aa  212  9e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0497935  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4651  hypothetical protein  36.29 
 
 
419 aa  206  7e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2085  hypothetical protein  36.08 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230868  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0171  Uncharacterized protein family UPF0324  37.97 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4671  hypothetical protein  37.3 
 
 
449 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1635  hypothetical protein  36.62 
 
 
436 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.972059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1220  Uncharacterized protein family UPF0324  35.79 
 
 
593 aa  179  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000121334  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2815  Uncharacterized protein family UPF0324  36.62 
 
 
434 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2707  hypothetical protein  39.3 
 
 
423 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000039594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3343  hypothetical protein  39.81 
 
 
445 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3265  hypothetical protein  39.2 
 
 
445 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0046  hypothetical protein  36.8 
 
 
473 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4668  hypothetical protein  38.57 
 
 
450 aa  173  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000013133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3152  hypothetical protein  41.24 
 
 
445 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1096  hypothetical protein  34.97 
 
 
430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.710069  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2170  hypothetical protein  37.35 
 
 
593 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3021  hypothetical protein  37.17 
 
 
473 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3539  hypothetical protein  38.01 
 
 
582 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.892455  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2656  hypothetical protein  38.97 
 
 
580 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1363  hypothetical protein  38.19 
 
 
580 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0334  hypothetical protein  34.57 
 
 
436 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1098  hypothetical protein  38.8 
 
 
579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0876  hypothetical protein  38.41 
 
 
611 aa  147  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000553707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2042  hypothetical protein  35.6 
 
 
579 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2376  hypothetical protein  30.91 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3183  Uncharacterized protein family UPF0324  36.4 
 
 
327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2550  Uncharacterized protein family UPF0324  36.42 
 
 
348 aa  123  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164306  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0904  hypothetical protein  34.02 
 
 
478 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1255  hypothetical protein  33.47 
 
 
360 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000129603 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2840  hypothetical protein  33.73 
 
 
360 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1861  hypothetical protein  28.1 
 
 
357 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2400  hypothetical protein  31.32 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.989998  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0041  hypothetical protein  29.74 
 
 
352 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1033  hypothetical protein  30.77 
 
 
480 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000031212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2155  hypothetical protein  34.37 
 
 
473 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.639036  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0852  hypothetical protein  32.84 
 
 
472 aa  113  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.497351 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1808  hypothetical protein  32.08 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.846437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1188  Uncharacterized protein family UPF0324  32.38 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2603  hypothetical protein  30.25 
 
 
369 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  30.19 
 
 
360 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  30.19 
 
 
360 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1683  hypothetical protein  35.39 
 
 
487 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000210217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1452  hypothetical protein  33.02 
 
 
498 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2092  hypothetical protein  28.12 
 
 
479 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1866  hypothetical protein  28.25 
 
 
374 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0464995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  32.51 
 
 
355 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0423  hypothetical protein  32.62 
 
 
331 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.198162 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2603  hypothetical protein  31.6 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.864211  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1236  hypothetical protein  32.07 
 
 
348 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  26.62 
 
 
338 aa  96.3  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  27.36 
 
 
335 aa  95.1  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.3 
 
 
339 aa  94  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0247  hypothetical protein  32.91 
 
 
489 aa  92.8  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0302693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  29.21 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  31.83 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  31.63 
 
 
324 aa  90.1  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0930  hypothetical protein  26.59 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0225684  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  28.03 
 
 
348 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  27.78 
 
 
349 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  27.78 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  27.78 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  27.78 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0966  Uncharacterized protein family UPF0324  29.74 
 
 
493 aa  89.4  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000478324  hitchhiker  0.0000000801244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  29.66 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  27.78 
 
 
349 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.68 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  25.52 
 
 
335 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  28.82 
 
 
343 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  28.9 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  30.94 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  29.53 
 
 
355 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  28.9 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  31.83 
 
 
352 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  23.45 
 
 
337 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  29.28 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  25.19 
 
 
357 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.57 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  26.86 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1977  hypothetical protein  33.16 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000159953  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  28.74 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  30.89 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  29.01 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.01 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.01 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  27.55 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>