More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1551 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  100 
 
 		 542 aa  1102    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  52.39 
 
 		 542 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  51.37 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  50.74 
 
 		 537 aa  487  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  51.83 
 
 		 538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  47.99 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  41.48 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  37.25 
 
 		 541 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  39.12 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  37.22 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  34.06 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  36.48 
 
 		 603 aa  293  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  36.61 
 
 		 564 aa  280  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  35.6 
 
 		 560 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.42 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  34.62 
 
 		 560 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 569 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.59 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  35.29 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  34.84 
 
 		 560 aa  258  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 556 aa  258  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  35.8 
 
 		 620 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  35.6 
 
 		 576 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  32.21 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  32.25 
 
 		 613 aa  253  9.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  34 
 
 		 606 aa  249  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.05 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  35.77 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  35.79 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  35.79 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  34.23 
 
 		 543 aa  246  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  33.94 
 
 		 575 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  34.92 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 550 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  33.46 
 
 		 573 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  33.14 
 
 		 556 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  34.6 
 
 		 574 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.01 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  35.9 
 
 		 543 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  32.41 
 
 		 564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  32.25 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  32.86 
 
 		 553 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.21 
 
 		 556 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  32.39 
 
 		 557 aa  232  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  34.39 
 
 		 583 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  34.42 
 
 		 579 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.91 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.94 
 
 		 565 aa  227  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  31.86 
 
 		 619 aa  226  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  33.83 
 
 		 530 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  32.8 
 
 		 601 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  31.76 
 
 		 582 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.88 
 
 		 543 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  31.36 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  28.77 
 
 		 580 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.25 
 
 		 564 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.17 
 
 		 544 aa  212  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.22 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  32.07 
 
 		 565 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  32.41 
 
 		 550 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  34.55 
 
 		 536 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  30.09 
 
 		 585 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.21 
 
 		 522 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.64 
 
 		 584 aa  204  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  31.28 
 
 		 580 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3767  amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 544 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  30 
 
 		 563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 563 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 547 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  31.69 
 
 		 563 aa  197  5.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.62 
 
 		 539 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3759  amidohydrolase 3  31.16 
 
 		 529 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  29.45 
 
 		 544 aa  196  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.85 
 
 		 543 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 539 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  32.55 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  34.3 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  30.36 
 
 		 580 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0990  urease domain-containing protein  28.47 
 
 		 563 aa  193  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  32.23 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  34 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  30.56 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.05 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.43 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 568 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  34.37 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.44 
 
 		 568 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  30.1 
 
 		 542 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  30.05 
 
 		 562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.72 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.85 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>