More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1372 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 199 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  74.74 
 
 		 202 aa  276  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  74.61 
 
 		 202 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  73 
 
 		 223 aa  266  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  63.08 
 
 		 193 aa  251  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  69.04 
 
 		 205 aa  248  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  65.83 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  65.83 
 
 		 221 aa  247  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  67 
 
 		 205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  66.5 
 
 		 210 aa  241  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  67.16 
 
 		 208 aa  240  7.999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  67.53 
 
 		 220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  65.8 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  69.77 
 
 		 212 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  66.15 
 
 		 203 aa  237  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 		 203 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  66.67 
 
 		 215 aa  235  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  64.39 
 
 		 204 aa  235  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  67.01 
 
 		 204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  64.8 
 
 		 200 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  64.14 
 
 		 201 aa  227  9e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  62.31 
 
 		 226 aa  226  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  61.88 
 
 		 207 aa  224  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  63.9 
 
 		 209 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  59.3 
 
 		 222 aa  214  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  55.9 
 
 		 221 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 238 aa  211  7e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  61.14 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  58.25 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  62.05 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 227 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  54.37 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  56.92 
 
 		 216 aa  201  9e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 226 aa  197  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  51.28 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 214 aa  194  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 217 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  53.61 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  54.12 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  57.87 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.37 
 
 		 233 aa  188  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  53.73 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  55.45 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  58.6 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  54 
 
 		 227 aa  185  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 		 216 aa  185  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  54.87 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  59.41 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  50.52 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  49.23 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  51.55 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  54.82 
 
 		 196 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 214 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  52.06 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 		 217 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 219 aa  177  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  48.47 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 217 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  47.96 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  47.92 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  47.92 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  52.79 
 
 		 220 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  48.29 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  46.46 
 
 		 198 aa  174  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 219 aa  174  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  47.45 
 
 		 222 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.97 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  46.39 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>