More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1334 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1334  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  100 
 
 
295 aa  575  1e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2774  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  71.13 
 
 
291 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3389  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  71.13 
 
 
286 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2539  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  67.38 
 
 
287 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0444448  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4736  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  67.23 
 
 
296 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  61.19 
 
 
289 aa  327  2e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2224  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  59.72 
 
 
289 aa  324  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.844941  hitchhiker  0.000850669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  38.32 
 
 
275 aa  164  2e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1453  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  39.71 
 
 
461 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.21 
 
 
305 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2603  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  39.25 
 
 
468 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1474  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.46 
 
 
570 aa  140  2e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  34.96 
 
 
280 aa  139  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.81 
 
 
304 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0259  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.77 
 
 
514 aa  135  6e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  35.93 
 
 
276 aa  135  7e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5684  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  41.02 
 
 
299 aa  132  7e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308299  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.12 
 
 
295 aa  132  8e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0433  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  35.38 
 
 
450 aa  131  1e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.649108  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4157  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.23 
 
 
292 aa  130  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02662  hypothetical protein  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3027  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.8 
 
 
287 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02700  xanthine dehydrogenase, FAD-binding subunit  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0841  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0825  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.23 
 
 
292 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  32.87 
 
 
284 aa  129  4e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1636  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  38.87 
 
 
490 aa  129  5e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0777  xanthine dehydrogenase, FAD-binding protein, putative  37.13 
 
 
288 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0920  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.13 
 
 
288 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.815419  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3192  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  30.88 
 
 
292 aa  128  1e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  32.52 
 
 
294 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2448  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.98 
 
 
507 aa  126  4e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.48 
 
 
292 aa  125  8e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1788  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.57 
 
 
467 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.350368  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  37.69 
 
 
281 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3102  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.98 
 
 
507 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238239  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1130  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.02 
 
 
507 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.16283  normal  0.329933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1339  xanthine dehydrogenase, small subunit  34.64 
 
 
501 aa  118  1e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00017372  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0711  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.09 
 
 
520 aa  118  1e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.46 
 
 
282 aa  117  2e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0767  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  30.22 
 
 
281 aa  117  2e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  32.99 
 
 
294 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2424  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.29 
 
 
480 aa  116  4e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1167  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.79 
 
 
287 aa  116  4e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2699  xanthine dehydrogenase small subunit  32.28 
 
 
499 aa  116  4e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0728  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.73 
 
 
527 aa  116  4e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0348  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.58 
 
 
528 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3720  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.1 
 
 
493 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0832  2Fe-2S ferredoxin, iron-sulfur binding site  33.58 
 
 
528 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.57 
 
 
286 aa  115  7e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2425  ferredoxin:molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:(2Fe-2S)-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  31.52 
 
 
500 aa  115  8e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0771886  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  30.18 
 
 
496 aa  115  9e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0804  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.21 
 
 
523 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.46 
 
 
492 aa  115  1e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  32.53 
 
 
483 aa  115  1e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  31.47 
 
 
288 aa  114  2e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.07 
 
 
492 aa  114  2e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02515  putative xanthine dehydrogenase, XdhA subunit  31.62 
 
 
480 aa  114  2e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  30.07 
 
 
492 aa  114  2e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2772  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.11 
 
 
283 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  1.37285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0193  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  37.84 
 
 
273 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0893  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.27 
 
 
498 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366411  normal  0.919592 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  33.82 
 
 
485 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.85 
 
 
284 aa  112  7e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3924  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  32.84 
 
 
516 aa  112  8e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4864  xanthine dehydrogenase, iron-sulfur binding subunit  26.25 
 
 
494 aa  112  8e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5750  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  34.58 
 
 
284 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.436516  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1137  dehydrogenase  29.72 
 
 
282 aa  111  1e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  39.51 
 
 
845 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2552  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.84 
 
 
526 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.865646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0950  xanthine dehydrogenase, subunit A  32.07 
 
 
543 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  29.02 
 
 
292 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.45 
 
 
306 aa  108  7e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5517  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  33.67 
 
 
284 aa  108  8e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.45 
 
 
289 aa  108  8e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  33.81 
 
 
485 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3460  xanthine dehydrogenase, small subunit  32.97 
 
 
530 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.266307 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1322  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  29.43 
 
 
276 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.81 
 
 
485 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0226  xanthine dehydrogenase, small subunit  30.53 
 
 
497 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183423  normal  0.106399 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  31.25 
 
 
288 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1444  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.8 
 
 
280 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1571  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  34.84 
 
 
300 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118942  normal  0.376201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2095  putative xanthine dehydrogenase (subunit A) oxidoreductase protein  31.05 
 
 
516 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3041  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.38 
 
 
515 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0266852 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4273  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  33.59 
 
 
271 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  30.07 
 
 
288 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22290  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.52 
 
 
496 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  29.07 
 
 
488 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  33.22 
 
 
285 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  28.42 
 
 
290 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2751  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.79 
 
 
479 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433722  normal  0.51663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0713  xanthine dehydrogenase, small subunit  31.84 
 
 
512 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1789  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.93 
 
 
484 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  36.02 
 
 
467 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0849  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  31.05 
 
 
270 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1035  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  30.15 
 
 
506 aa  99.8  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.22588  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5185  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  33.1 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.192099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>