More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1315 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  67.84 
 
 
287 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  57.99 
 
 
303 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  54.08 
 
 
316 aa  285  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  48.31 
 
 
325 aa  270  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  50 
 
 
313 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  48.64 
 
 
310 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  48.12 
 
 
312 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  48.97 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  47.96 
 
 
311 aa  254  9e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  44.18 
 
 
311 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  50.68 
 
 
319 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  40.67 
 
 
314 aa  239  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  47.22 
 
 
325 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  49.49 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  38.7 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  46.88 
 
 
295 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  41.75 
 
 
316 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  47.6 
 
 
320 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  46.13 
 
 
314 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  30.54 
 
 
418 aa  134  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  28.48 
 
 
337 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  30.06 
 
 
355 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  26.95 
 
 
310 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  30.74 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 
302 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  28.25 
 
 
381 aa  89.4  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  31.74 
 
 
629 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  30.51 
 
 
297 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  30.03 
 
 
311 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1583  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.63 
 
 
637 aa  85.5  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  34 
 
 
816 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  28.37 
 
 
807 aa  84  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2941  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 
801 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.651468  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  32.43 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.89 
 
 
800 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1442  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  30.3 
 
 
839 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.955782  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  30.52 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  31.05 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  29.39 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  27.21 
 
 
605 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  30.94 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.15 
 
 
617 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0549  methionine synthase (B12-dependent)  30.72 
 
 
804 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  27.74 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  27.15 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0489  homocysteine S-methyltransferase  29.31 
 
 
804 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2921  5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase, truncation  31.53 
 
 
804 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  30.07 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  31.92 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.42 
 
 
604 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.9 
 
 
615 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.51 
 
 
609 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  29.59 
 
 
801 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0656  homocysteine S-methyltransferase  27.4 
 
 
768 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0645  methionine synthase (B12-dependent)  25.17 
 
 
804 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.474097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  25.57 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2048  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.95 
 
 
614 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  29.53 
 
 
806 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  27.46 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1548  homocysteine S-methyltransferase  28.72 
 
 
804 aa  73.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0662443  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0680  homocysteine S-methyltransferase  27.05 
 
 
768 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.412837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0073  homocysteine S-methyltransferase  28.82 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0415  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.6 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0405  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  25.6 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  27.84 
 
 
358 aa  72.4  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  25.35 
 
 
434 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  31.58 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  25.74 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  24.16 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1406  homocysteine S-methyltransferase, putative  23.33 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0035  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.49 
 
 
612 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  28.57 
 
 
819 aa  70.1  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.63 
 
 
615 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1670  homocysteine S-methyltransferase family protein  24.16 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  27.85 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.34 
 
 
605 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  31.27 
 
 
300 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3081  homocysteine S-methyltransferase  25.67 
 
 
791 aa  68.9  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.99 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0650  B12-dependent methionine synthase  28.84 
 
 
1250 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  29.71 
 
 
1247 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3878  methionine synthase  28.48 
 
 
1208 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00387489  normal  0.106452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  31.39 
 
 
1259 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  29.81 
 
 
1226 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2544  methionine synthase  27.06 
 
 
1180 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00356448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  30.35 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2137  methionine synthase  30.94 
 
 
1245 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.39755 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.67 
 
 
616 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0266464  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1792  homocysteine S-methyltransferase  25.67 
 
 
774 aa  66.6  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.709712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0262  homocysteine S-methyltransferase  28.43 
 
 
813 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00180962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1882  B12-dependent methionine synthase  27.55 
 
 
1250 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.820569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1601  B12-dependent methionine synthase  27.55 
 
 
1250 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  28.67 
 
 
818 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  23.86 
 
 
780 aa  65.9  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0839  homocysteine S-methyltransferase  27.24 
 
 
285 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  29.87 
 
 
610 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0277  homocysteine S-methyltransferase  29.33 
 
 
811 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.357222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>