More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1300 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.35 
 
 
609 aa  638    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  62.02 
 
 
603 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  63.15 
 
 
584 aa  647    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  69.03 
 
 
605 aa  771    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
574 aa  1137    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  77.04 
 
 
574 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  59.12 
 
 
566 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  57.71 
 
 
585 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3128  hypothetical protein  58.56 
 
 
601 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  56.79 
 
 
607 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  55.52 
 
 
584 aa  559  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  54.48 
 
 
578 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.37 
 
 
584 aa  553  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  56.39 
 
 
590 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1378  hypothetical protein  55.73 
 
 
578 aa  553  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  54.68 
 
 
570 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.63 
 
 
595 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3243  hypothetical protein  57.35 
 
 
613 aa  547  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119574  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  55.7 
 
 
601 aa  542  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1027  hypothetical protein  57.07 
 
 
590 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  58.06 
 
 
631 aa  535  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  51.6 
 
 
616 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  52.59 
 
 
617 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2686  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.77 
 
 
610 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.700207  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  51.35 
 
 
630 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  51.17 
 
 
630 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  51.17 
 
 
630 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.15 
 
 
595 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  48.15 
 
 
645 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  46.08 
 
 
551 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.53 
 
 
565 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  39.71 
 
 
560 aa  243  7.999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1467  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.68 
 
 
475 aa  178  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.230111  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.23 
 
 
476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.53 
 
 
463 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.96 
 
 
456 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  32.97 
 
 
631 aa  157  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  43.88 
 
 
1397 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.18 
 
 
462 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  39.01 
 
 
753 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  46.41 
 
 
1440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.28 
 
 
453 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  44.38 
 
 
1433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  29.17 
 
 
457 aa  147  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  28.48 
 
 
615 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2829  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
747 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
674 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
747 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2884  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
749 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  44.94 
 
 
1442 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.21 
 
 
453 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 
673 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  33.22 
 
 
1407 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  37.83 
 
 
731 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
616 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  36.77 
 
 
740 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0552  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
749 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344791  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1739  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
742 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00965022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1779  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
747 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.130591  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2456  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
747 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710072  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2824  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 
747 aa  144  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643024  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
657 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  36.44 
 
 
657 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  37.67 
 
 
663 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  30.36 
 
 
614 aa  143  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
681 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
681 aa  143  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
682 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  37.78 
 
 
653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  37.39 
 
 
677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2845  excinuclease ABC subunit C  37.7 
 
 
762 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  40.66 
 
 
1465 aa  141  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 
654 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  30.03 
 
 
625 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
684 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 
1449 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  36.96 
 
 
684 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  29.66 
 
 
641 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  30.77 
 
 
614 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  39.61 
 
 
1449 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  31.65 
 
 
628 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2392  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.31 
 
 
398 aa  140  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  29.97 
 
 
645 aa  140  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  31.45 
 
 
596 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.09 
 
 
599 aa  137  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  38.54 
 
 
379 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  32.13 
 
 
624 aa  138  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 
619 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  40.76 
 
 
1527 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 
627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0415  excinuclease ABC, C subunit  36.22 
 
 
620 aa  137  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  36.89 
 
 
1390 aa  136  8e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2656  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.32 
 
 
456 aa  137  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.60887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  29.28 
 
 
593 aa  137  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  36.64 
 
 
671 aa  136  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.65 
 
 
482 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 
519 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  28.19 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 
617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  43 
 
 
1444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>