More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1264 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  100 
 
 
262 aa  525  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  76.92 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5673  Methyltransferase type 11  61.21 
 
 
304 aa  335  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.301349 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  63.02 
 
 
276 aa  333  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  63.02 
 
 
293 aa  329  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  60.47 
 
 
269 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  60.23 
 
 
282 aa  315  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  60.71 
 
 
286 aa  308  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  57.14 
 
 
276 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  61.2 
 
 
278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  59.84 
 
 
283 aa  301  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  58.04 
 
 
316 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  58.08 
 
 
284 aa  299  4e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  58.08 
 
 
269 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  56.15 
 
 
274 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  59.14 
 
 
274 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  58.87 
 
 
362 aa  291  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  58.08 
 
 
266 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  55.39 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  57.53 
 
 
299 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  58.59 
 
 
277 aa  262  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1227  Methyltransferase type 11  49.03 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
266 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  36.65 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04785  hypothetical SAM-dependent methyltransferase  27.78 
 
 
266 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
242 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
269 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35.5 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  38.83 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.36 
 
 
242 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.15 
 
 
236 aa  89  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2516  hypothetical protein  28.43 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000821985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1223  methyltransferase type 12  30.26 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  35.64 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.74 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  36.17 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  30 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.24 
 
 
236 aa  82  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  33.85 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  33.85 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0266  hypothetical protein  30.4 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.88 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  33.85 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  33.85 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2897  hypothetical protein  28.93 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000728381  normal  0.0956288 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  33.85 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2439  hypothetical protein  28.93 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4905  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0601285  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2310  hypothetical protein  27.92 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00350604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2485  hypothetical protein  27.92 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000990951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  39.74 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2777  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.62 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3001  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5365  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.163211  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2278  methyltransferase  27.41 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221713  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  28.88 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.53 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1328  methyl transferase  30.22 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.53 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.79 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  37.34 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.1 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  44.25 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  27.09 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32880  hypothetical protein  27.17 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.463874  hitchhiker  0.000230031 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.95 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.95 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.95 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 
225 aa  75.1  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.09 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
209 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  32.78 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  33.64 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  30.05 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2797  hypothetical protein  26.79 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2960  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1234  Methyltransferase type 12  28.52 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal  0.802761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  42.28 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  25 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232825  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>