More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1256 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
407 aa  791    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  70.08 
 
 
398 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  60.78 
 
 
412 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
419 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 
419 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
445 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  38.82 
 
 
450 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  40.55 
 
 
419 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  39.34 
 
 
450 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  40.55 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 
410 aa  206  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 
471 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  37.43 
 
 
413 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.97 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 
433 aa  173  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  28.14 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 
415 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
420 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
405 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.29 
 
 
423 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.54 
 
 
423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
423 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.38 
 
 
423 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
423 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  30.19 
 
 
423 aa  137  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.38 
 
 
423 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.12 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.87 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  30 
 
 
395 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
422 aa  132  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  29.54 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.97 
 
 
424 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.1 
 
 
424 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.85 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
401 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
428 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
419 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
426 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.41 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10859  integral membrane protein  31.15 
 
 
442 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000464176 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.43 
 
 
402 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  26.77 
 
 
416 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
423 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
397 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.91 
 
 
419 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.62 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.17 
 
 
427 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.39 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.26 
 
 
434 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
452 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.74 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.18 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.32 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.65 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.91 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.91 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.45 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.65 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.98 
 
 
418 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.64 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.65 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  29.65 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  23.05 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  21.88 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.38 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  25.56 
 
 
401 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.96 
 
 
418 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.38 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.1 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.1 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.92 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.19 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
407 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.08 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  28.35 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.38 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.74 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  22.91 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.41 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.78 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  22.87 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.48 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.5 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>