84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1242 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 432 aa  841    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  54.17 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  47.56 
 
 		 431 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  44.01 
 
 		 434 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5720  hypothetical protein  36.18 
 
 		 460 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.412673  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4934  transcriptional regulator, XRE family  34.45 
 
 		 487 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3542  helix-turn-helix domain-containing protein  35.15 
 
 		 442 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  0.855489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2224  helix-turn-helix domain protein  39.82 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.163485  hitchhiker  0.00213028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9326  putative transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 452 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.607046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0826  transcriptional regulator, XRE family  36.44 
 
 		 446 aa  107  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1606  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1781  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1730  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1606  DNA-binding protein  43.84 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3595  DNA-binding protein  40 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1807  DNA-binding protein  41.38 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1861  DNA-binding protein  40.23 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1748  DNA-binding protein  45.9 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  44.78 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  44.78 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0397  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264481  normal  0.0251152 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 96 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 69 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 152 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  37.04 
 
 		 488 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 176 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 70 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 188 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  43.33 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 256 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.94 
 
 		 114 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  43.33 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  27.07 
 
 		 206 aa  46.6  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 152 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 218 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 76 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.67 
 
 		 122 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  46.88 
 
 		 84 aa  46.6  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.67 
 
 		 122 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  26.67 
 
 		 122 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10472  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 76 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2204  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 107 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000000112019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1868  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2077  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0761  hypothetical protein  38.1 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1992  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 81 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1747  transcriptional regulator, XRE family  32.99 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 179 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 505 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 181 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 118 aa  44.3  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0799  hypothetical protein  44.07 
 
 		 475 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0627  hypothetical protein  42.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.995567  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2452  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 292 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 105 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0109  hypothetical protein  42.37 
 
 		 482 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.07895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 112 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2884  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.308835 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  33.33 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0647  hypothetical protein  42.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0634  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2542  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 165 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 71 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.78 
 
 		 1147 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0335  helix-turn-helix domain protein  34.45 
 
 		 301 aa  43.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 404 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 194 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 179 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06770  predicted transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  43.1  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>