266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1236 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1236  threonine aldolase  100 
 
 
368 aa  738    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0865335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2555  Threonine aldolase  73.39 
 
 
352 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913127  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5175  Threonine aldolase  64.69 
 
 
359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1982  Threonine aldolase  67.42 
 
 
351 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1658  L-threonine aldolase  62.57 
 
 
362 aa  444  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4532  Threonine aldolase  64.89 
 
 
369 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.334548  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1651  Threonine aldolase  61.41 
 
 
365 aa  432  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000248071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0686  L-threonine aldolase  63.01 
 
 
352 aa  428  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.55205  normal  0.813644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01000  L-threonine aldolase  61.84 
 
 
357 aa  422  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1898  Threonine aldolase  61.56 
 
 
375 aa  391  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0921  Threonine aldolase  58.43 
 
 
350 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0329  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  56.25 
 
 
375 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30040  L-threonine aldolase  56.66 
 
 
353 aa  362  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5568  Threonine aldolase  57.34 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5642  L-threonine aldolase  58.54 
 
 
358 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5263  L-threonine aldolase  58.26 
 
 
358 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5352  L-threonine aldolase  58.26 
 
 
358 aa  358  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1286  threonine aldolase  52.77 
 
 
340 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.78945  normal  0.413936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0572  Threonine aldolase  52.03 
 
 
341 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0393816 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1657  L-threonine aldolase  53.06 
 
 
339 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.789065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9381  Threonine aldolase  52.2 
 
 
352 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2606  threonine aldolase  47.95 
 
 
346 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0112  Threonine aldolase  52.59 
 
 
387 aa  322  7e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2821  Threonine aldolase  48.56 
 
 
343 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0977479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1003  Threonine aldolase  49.28 
 
 
361 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1000  Threonine aldolase  49.28 
 
 
371 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0942  L-threonine aldolase  48.99 
 
 
361 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1610  threonine aldolase  47.97 
 
 
343 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5210  L-threonine aldolase  46.24 
 
 
346 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1314  L-threonine aldolase  48.85 
 
 
343 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341483  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4886  threonine aldolase  46.7 
 
 
346 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.694097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0344  threonine aldolase  47.08 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0343  threonine aldolase  47.08 
 
 
346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0983  threonine aldolase  49.29 
 
 
348 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00961292  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4766  threonine aldolase  46.78 
 
 
346 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.168867 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0754  Threonine aldolase  48.4 
 
 
348 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0601486 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0321  threonine aldolase  46.42 
 
 
346 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000281363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0809  L-threonine aldolase  48.26 
 
 
350 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.107149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4134  L-threonine aldolase  46.82 
 
 
346 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000248279  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0410  threonine aldolase, low-specificity  47.08 
 
 
346 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0859  L-threonine aldolase  48.1 
 
 
346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0824  Threonine aldolase  48.4 
 
 
348 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3318  Threonine aldolase  47.23 
 
 
346 aa  285  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0808  low specificity L-threonine aldolase protein  48.4 
 
 
345 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.672671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3442  Threonine aldolase  46.94 
 
 
346 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3121  threonine aldolase  46.94 
 
 
346 aa  281  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021379  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4955  L-threonine aldolase  42.21 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6201  low specificity l-threonine aldolase  47.51 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71440  low specificity l-threonine aldolase  47.51 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000654342  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3408  L-threonine aldolase, low-specificity  44.9 
 
 
351 aa  271  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1277  Threonine aldolase  48.43 
 
 
357 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1870  threonine aldolase  42.44 
 
 
355 aa  266  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.163709  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3333  Threonine aldolase  43.18 
 
 
347 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5537  threonine aldolase  47.09 
 
 
348 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.145661  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2289  Threonine aldolase  42.11 
 
 
353 aa  263  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000548444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1928  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.4 
 
 
352 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1179  threonine aldolase  44.31 
 
 
343 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191301  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0880  L-threonine aldolase  44.74 
 
 
349 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1555  threonine aldolase  44.83 
 
 
364 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.746494 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1646  L-threonine aldolase  41.67 
 
 
349 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3503  L-threonine aldolase  41.92 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5153  threonine aldolase  47.64 
 
 
374 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.7123  normal  0.210542 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0678  Threonine aldolase  45.82 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4021  threonine aldolase  43.73 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531782  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1475  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  41.67 
 
 
356 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3664  threonine aldolase  42.65 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0977  threonine aldolase  43.6 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.722961  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2745  L-threonine aldolase  42.53 
 
 
352 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0052  threonine aldolase, low-specificity, putative  39.89 
 
 
349 aa  228  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4278  threonine aldolase  41.55 
 
 
349 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431757  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2302  L-threonine aldolase  44.19 
 
 
341 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2249  L-threonine aldolase  41.57 
 
 
349 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4433  threonine aldolase  41.91 
 
 
353 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05504  putative low specificity L-threonine aldolase protein  40.41 
 
 
365 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.264443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3736  threonine aldolase  40.94 
 
 
348 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1169  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  42.57 
 
 
353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1430  L-threonine aldolase  46.15 
 
 
350 aa  212  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3876  Threonine aldolase  42.86 
 
 
350 aa  210  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.533395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1966  threonine aldolase  40.7 
 
 
345 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2014  Threonine aldolase  41.14 
 
 
351 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316829  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2198  threonine aldolase  45.4 
 
 
341 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1844  threonine aldolase  37.43 
 
 
355 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.95316  normal  0.0155245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2712  threonine aldolase  40.35 
 
 
348 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3267  L-threonine aldolase  41.86 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1813  threonine aldolase  42.49 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3617  Threonine aldolase  37.04 
 
 
350 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2153  L-threonine aldolase  36.99 
 
 
338 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.708772  normal  0.227327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3029  threonine aldolase  41.11 
 
 
357 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1081  Threonine aldolase  34.71 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00175946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0496  threonine aldolase  41.48 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3318  Threonine aldolase  37.18 
 
 
350 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.410103  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7125  Threonine aldolase  34.3 
 
 
339 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0102  Threonine aldolase  33.91 
 
 
342 aa  169  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0474  low-specificity L-threonine aldolase  35.07 
 
 
345 aa  169  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0904  threonine aldolase  32.09 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000336158  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0635  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  31.66 
 
 
344 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.538663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0005  L-threonine aldolase, low-specificity  30.77 
 
 
351 aa  160  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0742  threonine aldolase  41.5 
 
 
339 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2181  threonine aldolase  31.81 
 
 
346 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0421215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1176  L-threonine aldolase  39.66 
 
 
340 aa  159  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>