148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1173 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
180 aa  347  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  48.91 
 
 
216 aa  104  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
161 aa  89  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  46.02 
 
 
181 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.97 
 
 
130 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.94 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 
1039 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.79 
 
 
616 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  40.62 
 
 
591 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  43.12 
 
 
817 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2641  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.28 
 
 
122 aa  72  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000159202  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.09 
 
 
146 aa  71.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.82 
 
 
1045 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.13 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.82 
 
 
952 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  36.61 
 
 
722 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  43.24 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  41.03 
 
 
713 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  37.32 
 
 
282 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  40 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.72 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  39.47 
 
 
697 aa  62  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
152 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
356 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  37.17 
 
 
573 aa  61.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 
151 aa  61.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.21 
 
 
142 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.21 
 
 
738 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.45 
 
 
579 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
160 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.96 
 
 
251 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.47 
 
 
141 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.64 
 
 
151 aa  58.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 
142 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4104  stage II sporulation E family protein  36.22 
 
 
694 aa  58.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.93 
 
 
211 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.4 
 
 
549 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 
207 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  37.93 
 
 
195 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.11 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
135 aa  54.7  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.3 
 
 
137 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
135 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.96 
 
 
234 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  32.89 
 
 
693 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  38.74 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
855 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  29.45 
 
 
744 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  35.29 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  34.03 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.35 
 
 
143 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 
227 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2474  hypothetical protein  39.84 
 
 
132 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2543  hypothetical protein  35.21 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000143777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  36.8 
 
 
123 aa  52.4  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  32.54 
 
 
145 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
134 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
119 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
135 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  34.01 
 
 
766 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.39 
 
 
743 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  32.56 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3207  anti-sigma-factor antagonist  32.26 
 
 
281 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3450  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.850015  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  37.72 
 
 
693 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
150 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
150 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.59 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.04 
 
 
281 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  32.74 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
134 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.98 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  30.19 
 
 
800 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
149 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 
150 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  36.21 
 
 
365 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  33.59 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.19 
 
 
1225 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
746 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>