251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1150 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
340 aa  678    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  78.82 
 
 
337 aa  541  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  78.24 
 
 
337 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  70.8 
 
 
343 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  69.91 
 
 
337 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  64.41 
 
 
340 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  64.71 
 
 
343 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  62.94 
 
 
341 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  62.91 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  64.12 
 
 
340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  63.82 
 
 
351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  62.83 
 
 
339 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  61.76 
 
 
339 aa  401  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  63.24 
 
 
339 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  61.34 
 
 
337 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  61.45 
 
 
346 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  63.13 
 
 
340 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.77 
 
 
344 aa  380  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  58.02 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  58.02 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  58.02 
 
 
347 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.11 
 
 
340 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  56.93 
 
 
343 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  57.48 
 
 
343 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  55.43 
 
 
343 aa  358  8e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.46 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.18 
 
 
344 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.43 
 
 
340 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  56.3 
 
 
337 aa  345  6e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.69 
 
 
341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  54.71 
 
 
337 aa  338  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.57 
 
 
346 aa  335  7e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.14 
 
 
339 aa  333  3e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.52 
 
 
337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  48.4 
 
 
350 aa  298  7e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.74 
 
 
336 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  43.78 
 
 
372 aa  271  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  42.61 
 
 
345 aa  268  7e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.53 
 
 
347 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.75 
 
 
343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.17 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.1 
 
 
344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.73 
 
 
347 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.95 
 
 
344 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.81 
 
 
343 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.57 
 
 
343 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  33.24 
 
 
339 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  33.52 
 
 
339 aa  206  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  37.31 
 
 
336 aa  206  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.4 
 
 
343 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.22 
 
 
345 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.62 
 
 
351 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.36 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.07 
 
 
357 aa  199  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  32.95 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  38.18 
 
 
336 aa  196  7e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.63 
 
 
344 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  32.07 
 
 
339 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 
341 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30 
 
 
348 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 
343 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.24 
 
 
337 aa  189  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  36.34 
 
 
334 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.12 
 
 
344 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.46 
 
 
345 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.48 
 
 
350 aa  185  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.86 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.78 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3576  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 
343 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 
357 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  34.07 
 
 
360 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.82 
 
 
348 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  34.31 
 
 
334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.27 
 
 
343 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.95 
 
 
344 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  30 
 
 
338 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.15 
 
 
343 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 
334 aa  176  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.39 
 
 
354 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  34.41 
 
 
349 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  34.5 
 
 
334 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  33.14 
 
 
342 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  35.25 
 
 
370 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  35.63 
 
 
338 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.38 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  29.43 
 
 
338 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 
349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  29.08 
 
 
338 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  36.92 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2813  negative regulator of class I heat shock protein  33.04 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.222938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.55 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.55 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.55 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  33.82 
 
 
334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  35.63 
 
 
337 aa  172  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.14 
 
 
359 aa  173  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  33.92 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>