More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1102 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  100 
 
 		 492 aa  962    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  72.5 
 
 		 484 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.18 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  48.78 
 
 		 490 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  46.37 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  49.5 
 
 		 498 aa  362  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  49.39 
 
 		 499 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1199  glycoside hydrolase family 3 protein  49.48 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  47.72 
 
 		 504 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  43 
 
 		 520 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  47.81 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.4 
 
 		 482 aa  291  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.4 
 
 		 594 aa  289  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43 
 
 		 530 aa  282  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  48.04 
 
 		 475 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.63 
 
 		 698 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.07 
 
 		 528 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  44.71 
 
 		 511 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.99 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  45.99 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.99 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.86 
 
 		 511 aa  223  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25420  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  44.84 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128783  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.61 
 
 		 543 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  38.32 
 
 		 520 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.42 
 
 		 596 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  30.93 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  38.73 
 
 		 845 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  44.95 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.72 
 
 		 543 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  43.89 
 
 		 420 aa  207  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  38.91 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  40.18 
 
 		 637 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.11 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  39.19 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.36 
 
 		 618 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  41.75 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  42.72 
 
 		 604 aa  203  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  43.99 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.38 
 
 		 582 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  46.22 
 
 		 538 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.12 
 
 		 591 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  39.76 
 
 		 656 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.94 
 
 		 398 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.17 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  38.38 
 
 		 589 aa  193  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.38 
 
 		 600 aa  189  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  36.64 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  42.21 
 
 		 631 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.72 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  29.9 
 
 		 541 aa  187  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.18 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 		 361 aa  187  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.06 
 
 		 573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.83 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  44.39 
 
 		 538 aa  183  7e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.05 
 
 		 478 aa  183  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.82 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.24 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  37.22 
 
 		 382 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  36.58 
 
 		 585 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.31 
 
 		 363 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.38 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.27 
 
 		 976 aa  176  8e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  37.31 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.86 
 
 		 953 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  40.19 
 
 		 575 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  35.16 
 
 		 992 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.61 
 
 		 552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  36.36 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.31 
 
 		 373 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  39.85 
 
 		 542 aa  173  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  35.34 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  40.65 
 
 		 1003 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.21 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0117  glycoside hydrolase family 3 protein  35.86 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.02 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  39.87 
 
 		 575 aa  170  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0793  glycosy hydrolase family protein  32.75 
 
 		 350 aa  169  7e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  36.84 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  40.38 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2357  glycoside hydrolase family 3 protein  35.06 
 
 		 393 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0168958  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.14 
 
 		 365 aa  167  5e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0119  glycoside hydrolase family 3 protein  34.87 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 		 358 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.8 
 
 		 990 aa  166  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  34.82 
 
 		 688 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.34 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  32.93 
 
 		 375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  36.15 
 
 		 1007 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.9 
 
 		 375 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.75 
 
 		 387 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  37 
 
 		 1012 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  39.11 
 
 		 997 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  35.63 
 
 		 537 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.22 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.43 
 
 		 392 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  41.26 
 
 		 549 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>