More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0989 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  100 
 
 
292 aa  581  1e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  61.69 
 
 
312 aa  335  4e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  53.5 
 
 
329 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.05 
 
 
300 aa  314  1e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.05 
 
 
300 aa  313  2e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.05 
 
 
300 aa  313  2e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  53.9 
 
 
295 aa  300  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41024e-08 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.86 
 
 
319 aa  298  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.04 
 
 
300 aa  298  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  57.24 
 
 
325 aa  298  7e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  6.58468e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  54.61 
 
 
317 aa  296  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  54.79 
 
 
308 aa  292  5e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  58.16 
 
 
303 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  58.31 
 
 
298 aa  289  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  56.76 
 
 
298 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.36053e-13  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  56.85 
 
 
289 aa  285  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  52.32 
 
 
325 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  52.94 
 
 
336 aa  276  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  54.19 
 
 
380 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  54.57 
 
 
336 aa  273  2e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  56.57 
 
 
304 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  55.52 
 
 
344 aa  269  3e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  57.53 
 
 
311 aa  265  6e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  48.15 
 
 
336 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  54.45 
 
 
308 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  50.15 
 
 
346 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  48.29 
 
 
332 aa  250  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.76 
 
 
322 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  47.64 
 
 
310 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  47.65 
 
 
363 aa  234  1e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  49.21 
 
 
385 aa  233  4e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.37 
 
 
355 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.73 
 
 
298 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.54 
 
 
293 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.69064e-10 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  47.53 
 
 
327 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  41.61 
 
 
302 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  41.3 
 
 
294 aa  221  1e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  43.2 
 
 
293 aa  221  1e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  37.85 
 
 
295 aa  220  2e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  43.43 
 
 
294 aa  219  4e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.38339e-06  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  44.59 
 
 
313 aa  216  3e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  6.34873e-09 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.1 
 
 
299 aa  215  6e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.9497e-06  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.76 
 
 
301 aa  214  1e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.89449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  42.95 
 
 
302 aa  214  1e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.62 
 
 
298 aa  214  1e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.76 
 
 
299 aa  214  1e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 
296 aa  213  2e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 
296 aa  213  2e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  214  2e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  3.17777e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  42.18 
 
 
294 aa  213  3e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.76 
 
 
299 aa  213  3e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.66 
 
 
300 aa  213  3e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  42 
 
 
332 aa  212  5e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  212  5e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07327e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  211  8e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.85052e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 
299 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  3.91393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
296 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  40.92 
 
 
317 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  39.04 
 
 
290 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 
296 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  41.72 
 
 
333 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.73 
 
 
299 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  8.55714e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  35.07 
 
 
296 aa  209  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  42.9 
 
 
304 aa  208  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  6.63621e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40.96 
 
 
295 aa  208  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  43.17 
 
 
307 aa  207  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  43.45 
 
 
294 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  37.58 
 
 
301 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  37.67 
 
 
295 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.73 
 
 
299 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  43.69 
 
 
302 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  41.11 
 
 
297 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  41.03 
 
 
317 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.63 
 
 
307 aa  205  6e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  37.97 
 
 
307 aa  205  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  41.1 
 
 
317 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 
294 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  40.7 
 
 
302 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.63 
 
 
307 aa  203  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  41.81 
 
 
320 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  38.13 
 
 
302 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  38.13 
 
 
302 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  38.01 
 
 
296 aa  201  1e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.64 
 
 
295 aa  200  2e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  39.06 
 
 
299 aa  201  2e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  41.64 
 
 
304 aa  200  2e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  40.14 
 
 
299 aa  199  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 
295 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  40.14 
 
 
312 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  36.61 
 
 
295 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  38.13 
 
 
302 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>