More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0986 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0986  ribonuclease H  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1834  Ribonuclease H  67.36 
 
 
228 aa  310  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1554  ribonuclease H  65.66 
 
 
307 aa  251  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0977063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1154  ribonuclease HII  63.29 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3417  Ribonuclease H  64.57 
 
 
232 aa  228  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4000  Ribonuclease H  60 
 
 
257 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1201  ribonuclease HII  62.8 
 
 
269 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.547748  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1312  ribonuclease HII  57.98 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3253  ribonuclease HII  57.89 
 
 
240 aa  218  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3588  ribonuclease HII  66.5 
 
 
240 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1519  Ribonuclease H  58.74 
 
 
224 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238626  hitchhiker  0.0075916 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12916  ribonuclease HII  55.56 
 
 
264 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.807847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5919  Ribonuclease H  58.42 
 
 
258 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00684807  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1952  ribonuclease HII  53.81 
 
 
239 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713982 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09810  RNase HII  56.31 
 
 
275 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.641782  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1972  ribonuclease HII  53.36 
 
 
239 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2018  ribonuclease HII  53.36 
 
 
239 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2194  ribonuclease HII  54.84 
 
 
249 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.325708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2189  Ribonuclease H  58.42 
 
 
211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0375118  normal  0.780394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4168  ribonuclease HII  54.42 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1632  Ribonuclease H  50.45 
 
 
228 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.771175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0664  ribonuclease HII  54.27 
 
 
267 aa  185  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0628332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2092  Ribonuclease H  53.2 
 
 
228 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.6 
 
 
210 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  51.93 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  51.93 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  51.4 
 
 
218 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  50.26 
 
 
235 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  43.62 
 
 
257 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  46.83 
 
 
214 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  52.22 
 
 
240 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  38.89 
 
 
206 aa  155  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.55 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  48.11 
 
 
198 aa  155  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  43.48 
 
 
268 aa  155  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  50.56 
 
 
240 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  44.16 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01115  ribonuclease HII  50 
 
 
211 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0002331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  48.9 
 
 
198 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  49.74 
 
 
229 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  43.09 
 
 
257 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.94 
 
 
229 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  44 
 
 
204 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  43.23 
 
 
216 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  38.38 
 
 
242 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  47.25 
 
 
208 aa  148  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  48.57 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  47.49 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  46.6 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  44.68 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  38.5 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  45.21 
 
 
257 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  48.62 
 
 
198 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  40.43 
 
 
256 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  44.68 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  38.5 
 
 
272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  46.7 
 
 
199 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  47.8 
 
 
198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  47.8 
 
 
198 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  44.86 
 
 
206 aa  144  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  47.8 
 
 
198 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  44.15 
 
 
257 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  42.61 
 
 
202 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  46.88 
 
 
258 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  42.61 
 
 
202 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  41.75 
 
 
230 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.83 
 
 
214 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  48.62 
 
 
198 aa  143  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  43.46 
 
 
257 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  43.46 
 
 
257 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1308  ribonuclease HII  43.62 
 
 
257 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000033795  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  42.19 
 
 
217 aa  142  5e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  44.15 
 
 
257 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  46.59 
 
 
197 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  47.51 
 
 
198 aa  142  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  47.12 
 
 
216 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40.1 
 
 
308 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  47.25 
 
 
197 aa  141  9e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.96 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.96 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0352  ribonuclease HII  47.92 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.227489  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  46.96 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  45.08 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  46.24 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  44.44 
 
 
249 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  44.39 
 
 
207 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0317  ribonuclease HII  47.4 
 
 
234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  43.41 
 
 
211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2563  ribonuclease HII  43.23 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00091403  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  45.81 
 
 
217 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  45.81 
 
 
217 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  38.57 
 
 
219 aa  139  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  44.1 
 
 
220 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  47.75 
 
 
208 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.55 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>