More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0906 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  100 
 
 
381 aa  747    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  46.65 
 
 
405 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.67 
 
 
426 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  45.94 
 
 
423 aa  208  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
404 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.87 
 
 
420 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  41.94 
 
 
383 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  42.56 
 
 
439 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  38.8 
 
 
399 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.11 
 
 
786 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
434 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  40.76 
 
 
407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  42.66 
 
 
369 aa  136  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.96 
 
 
369 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
393 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42 
 
 
404 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  39.17 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  41.35 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  43.81 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.92 
 
 
726 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  34.32 
 
 
376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  34.32 
 
 
376 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  41.75 
 
 
386 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
388 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
404 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  34.84 
 
 
376 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.3 
 
 
458 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  34.77 
 
 
385 aa  124  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  43.66 
 
 
699 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
376 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  35.14 
 
 
376 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  35.14 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  37.24 
 
 
400 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  33.48 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  32.6 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  41.15 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  31.72 
 
 
376 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
399 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.93 
 
 
430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  44.81 
 
 
363 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  38.89 
 
 
611 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  34.57 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.23 
 
 
581 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  38.12 
 
 
437 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  35.87 
 
 
381 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
363 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
359 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
372 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  40.24 
 
 
370 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  33.8 
 
 
380 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.13 
 
 
351 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
408 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
392 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
445 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  33.16 
 
 
359 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  33.33 
 
 
359 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.55 
 
 
354 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  32.22 
 
 
442 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
359 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
440 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
359 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.46 
 
 
382 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
393 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
359 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.98 
 
 
744 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
359 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.89 
 
 
392 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
367 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  36.97 
 
 
422 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
372 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
359 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
423 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  35.19 
 
 
399 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.6 
 
 
392 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.22 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.95 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.75 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  31.28 
 
 
395 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.36 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  37.69 
 
 
357 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.59 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
382 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  27.32 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
407 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.68 
 
 
406 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.29 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.7 
 
 
442 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.88 
 
 
357 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>