218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0835 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0835  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  931    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.500441  normal  0.402596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2399  hypothetical protein  70.97 
 
 
472 aa  599  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.722236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2548  hypothetical protein  70.97 
 
 
472 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0808238  decreased coverage  0.00000419114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2027  protein of unknown function UPF0027  74 
 
 
475 aa  594  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742967  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12650  hypothetical protein  71.23 
 
 
432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000105377  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0127  protein of unknown function UPF0027  49.9 
 
 
486 aa  465  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2151  hypothetical protein  52.58 
 
 
476 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2125  hypothetical protein  52.79 
 
 
476 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  50.11 
 
 
500 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1314  hypothetical protein  55.6 
 
 
477 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.171787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0966  protein of unknown function UPF0027  51.58 
 
 
484 aa  458  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  52.83 
 
 
478 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1950  protein of unknown function UPF0027  56.47 
 
 
476 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00816316  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1792  hypothetical protein  55.97 
 
 
477 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.873352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0129  hypothetical protein  52.06 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0195  hypothetical protein  54.22 
 
 
476 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.739539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0823  hypothetical protein  48.73 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.521188  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1281  hypothetical protein  47.58 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.141518  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3181  hypothetical protein  51.96 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2355  hypothetical protein  53.57 
 
 
486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.314227  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0742  hypothetical protein  50 
 
 
486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1018  protein of unknown function UPF0027  50.74 
 
 
477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0374  protein of unknown function UPF0027  52.75 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1472  hypothetical protein  47.27 
 
 
474 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1426  hypothetical protein  48.32 
 
 
474 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0019  hypothetical protein  52.98 
 
 
480 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1374  hypothetical protein  52.32 
 
 
473 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0186  hypothetical protein  47.37 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.490529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0637  hypothetical protein  47.16 
 
 
480 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0603804  normal  0.09209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1453  hypothetical protein  44.96 
 
 
482 aa  437  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0903  hypothetical protein  50.96 
 
 
475 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354068  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0269  hypothetical protein  48.64 
 
 
482 aa  435  1e-121  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1752  hypothetical protein  48.37 
 
 
460 aa  435  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000573149  normal  0.0520768 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0703  hypothetical protein  45.26 
 
 
480 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46150  hypothetical protein  54.04 
 
 
476 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.377544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2359  hypothetical protein  52.75 
 
 
476 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.442678 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2726  hypothetical protein  51.19 
 
 
493 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2571  hypothetical protein  49.58 
 
 
477 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.444433  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  47.11 
 
 
484 aa  425  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_727  hypothetical protein  47.89 
 
 
486 aa  428  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0681  hypothetical protein  44.71 
 
 
472 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1945  protein of unknown function UPF0027  45.53 
 
 
482 aa  425  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0738266  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0333  protein of unknown function UPF0027  51.5 
 
 
476 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3852  hypothetical protein  53.18 
 
 
476 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0480  hypothetical protein  53.85 
 
 
484 aa  418  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.188355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1728  hypothetical protein  54 
 
 
475 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  46.35 
 
 
498 aa  420  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1265  RtcB  49.67 
 
 
477 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.268683  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3271  protein of unknown function UPF0027  46.89 
 
 
486 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2207  hypothetical protein  48.05 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0989  protein of unknown function UPF0027  46.68 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  45.92 
 
 
484 aa  415  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4795  protein of unknown function UPF0027  48.11 
 
 
481 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  47 
 
 
484 aa  409  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0875  hypothetical protein  43.3 
 
 
443 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1619  hypothetical protein  46.36 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.691717  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1393  hypothetical protein  47.3 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2142  hypothetical protein  47.08 
 
 
485 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.053171  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  47.16 
 
 
473 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1684  hypothetical protein  47.46 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  46.74 
 
 
473 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2758  protein of unknown function UPF0027  46.04 
 
 
486 aa  389  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0799133  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25152  predicted protein  46.67 
 
 
514 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0747524  normal  0.0655449 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2560  protein of unknown function UPF0027  45.23 
 
 
488 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0414  protein of unknown function UPF0027  45.83 
 
 
488 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.042837  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  43.75 
 
 
484 aa  375  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2024  protein of unknown function UPF0027  44.86 
 
 
502 aa  369  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.724572  normal  0.445146 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0946  hypothetical protein  49.89 
 
 
487 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.504697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1004  protein of unknown function UPF0027  49.68 
 
 
488 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1007  protein of unknown function UPF0027  50.11 
 
 
487 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0324917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0986  hypothetical protein  49.05 
 
 
479 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0504  protein of unknown function UPF0027  50.26 
 
 
988 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2089  hypothetical protein  45.01 
 
 
478 aa  347  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0134  hypothetical protein  38.25 
 
 
963 aa  344  2e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  40.13 
 
 
462 aa  338  9e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22420  hypothetical protein  40.76 
 
 
447 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2183  protein of unknown function UPF0027  33.77 
 
 
451 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00364968  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2495  protein of unknown function UPF0027  31.66 
 
 
514 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  32.19 
 
 
396 aa  179  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  32.45 
 
 
384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  33.41 
 
 
395 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  31.38 
 
 
409 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5608  hypothetical protein  33.2 
 
 
511 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30311  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  32.88 
 
 
398 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  32.57 
 
 
402 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  29.69 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0923  hypothetical protein  34.22 
 
 
463 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  32.96 
 
 
395 aa  162  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5648  hypothetical protein  32.19 
 
 
472 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  31.97 
 
 
406 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  31.94 
 
 
409 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  32.52 
 
 
395 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  31.81 
 
 
388 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  30.67 
 
 
428 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3740  protein of unknown function UPF0027  32.22 
 
 
466 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.349709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  31.82 
 
 
406 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  31.11 
 
 
407 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  30.55 
 
 
411 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  30.32 
 
 
408 aa  155  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  30.89 
 
 
407 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>