More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0815 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  72.73 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  60 
 
 		 295 aa  322  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  58.25 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5452  transcriptional regulator, LysR family  56.16 
 
 		 297 aa  293  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  54.42 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  51.7 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  43.73 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  47.92 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  44.08 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  42.25 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  41.08 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  43.23 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  40.79 
 
 		 324 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  39.08 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  34.36 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  38.62 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  44.31 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  37.78 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  37.32 
 
 		 311 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 339 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  38.35 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  37.54 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  37.45 
 
 		 308 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 312 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  40.09 
 
 		 307 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  37.14 
 
 		 301 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.58 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  36.06 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  33.09 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  37.04 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  35.86 
 
 		 314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  35.16 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.26 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  37.93 
 
 		 308 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 298 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  37.28 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2544  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 300 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0984343  normal  0.803064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 296 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  36.29 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1711  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316204  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2214  transcriptional regulator, LysR family  34.5 
 
 		 331 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00637243  hitchhiker  0.0000100352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4412  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.481295  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  33.2 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4518  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 375 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4552  LysR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 307 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>