More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0813 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 
250 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2462  putative short chain dehydrogenase  61.96 
 
 
255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22830  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  60.25 
 
 
247 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.702609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
251 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.150929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
256 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
246 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.907428  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
260 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.362714  normal  0.975867 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
260 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
260 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3435  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.48 
 
 
249 aa  218  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.24 
 
 
247 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0286474  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
247 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0680281  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12109  short-chain type dehydrogenase  51.44 
 
 
249 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0969854  normal  0.809118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01390  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  47.81 
 
 
251 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.253341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13825  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 
254 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3873  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
257 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5001  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
256 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5089  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
256 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.415289 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5382  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
256 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
253 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5628  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
260 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.391011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1177  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
260 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56412  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.34 
 
 
254 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1741  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
252 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2567  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
245 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0896  short chain dehydrogenase  33.87 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6249  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
245 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0171  short chain dehydrogenase  34.43 
 
 
246 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.808724 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3786  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
246 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0143  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
243 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.896795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2832  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
244 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0580098  normal  0.214495 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2273  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
246 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal  0.452458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4050  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
243 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.119249  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2301  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00458311  hitchhiker  0.00750193 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1219  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
243 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
248 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
245 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3976  short chain dehydrogenase  42.71 
 
 
245 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00930617  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1950  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
246 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
254 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.904003  normal  0.571542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1026  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
270 aa  102  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.969015  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0498  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
243 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.795397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7180  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 
248 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367118  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2164  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
247 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1597  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139184  normal  0.109463 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03335  putative oxidoreductase  27.13 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.472323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1708  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.361807  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5791  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
244 aa  91.7  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.500614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.726547  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.96 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0695  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.08 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.62 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.43 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5291  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.4 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  30.23 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0885  short chain dehydrogenase  28.63 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2453  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2345  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
297 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190376  hitchhiker  0.00770319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5498  sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  29.29 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0469  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4481  sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  28.79 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.628006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.914636  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.77 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  34.2 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.5 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.94 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  28.37 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.1 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  26.83 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.7 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.88 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  29.51 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700746  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.646056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  26.83 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  26.83 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  28.02 
 
 
246 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>