191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0812 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0812  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 
454 aa  900    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  61.52 
 
 
452 aa  521  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  54.5 
 
 
468 aa  474  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  59.82 
 
 
455 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01400  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.99 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.276875  normal  0.198753 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1740  FAD linked oxidase domain protein  51.12 
 
 
462 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  48.55 
 
 
481 aa  397  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5000  FAD linked oxidase-like protein  47.44 
 
 
456 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5088  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.44 
 
 
456 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5381  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.44 
 
 
456 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  45.39 
 
 
452 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5627  FAD linked oxidase domain-containing protein  46.68 
 
 
463 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1178  FAD linked oxidase domain-containing protein  45.21 
 
 
472 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.41593  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13824  oxidoreductase  46.46 
 
 
461 aa  374  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  43.01 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0252  FAD linked oxidase domain protein  42.21 
 
 
474 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.297265  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
457 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  42.07 
 
 
457 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  43.08 
 
 
464 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  44.2 
 
 
440 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  42.92 
 
 
444 aa  313  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  37.36 
 
 
443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1027  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.43 
 
 
444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 
433 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1596  FAD linked oxidase domain protein  44.27 
 
 
472 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0268371  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3977  hypothetical protein  46.31 
 
 
442 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.217761  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0499  FAD linked oxidase domain protein  43.45 
 
 
437 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.18 
 
 
432 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  41.41 
 
 
433 aa  294  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  40.5 
 
 
444 aa  293  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  44.42 
 
 
432 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  36.43 
 
 
436 aa  286  5.999999999999999e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2163  FAD linked oxidase domain protein  41.87 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2272  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.71 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.284272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2831  FAD linked oxidase-like  41.99 
 
 
432 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104572  normal  0.14407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.14 
 
 
433 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1218  FAD linked oxidase-like  35.2 
 
 
430 aa  277  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1709  FAD linked oxidase, N-terminal  38.7 
 
 
432 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.605726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0063  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.69 
 
 
435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2965  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.76 
 
 
437 aa  263  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2302  FAD linked oxidase, N-terminal  40.4 
 
 
438 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0365618  hitchhiker  0.00922553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4797  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.77 
 
 
447 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0897  FAD linked oxidase domain protein  39.04 
 
 
438 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.566652  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3785  hypothetical protein  37.81 
 
 
438 aa  252  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4210  FAD linked oxidase-like  37.05 
 
 
436 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  0.793995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0172  hypothetical protein  41.1 
 
 
438 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.689653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 
425 aa  246  6.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1647  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 
433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1064  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.05 
 
 
441 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1758  hypothetical protein  30.97 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1758  hypothetical protein  30.67 
 
 
431 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 
445 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  21.79 
 
 
478 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  25.39 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  22.01 
 
 
478 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  21.54 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  21.54 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  21.54 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  21.54 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  21.54 
 
 
478 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  22.08 
 
 
468 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.03 
 
 
490 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  24.22 
 
 
434 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  20.9 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 
441 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  34.36 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  25.17 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  25.37 
 
 
427 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.83 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  22.47 
 
 
460 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2832  FAD linked oxidase-like protein  32.97 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  20.3 
 
 
475 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1829  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 
441 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  21.55 
 
 
481 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  26.14 
 
 
421 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  31.05 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  25.16 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.55 
 
 
449 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4772  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.82 
 
 
483 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  34.13 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1428  FAD linked oxidase domain protein  28.35 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0161  FAD linked oxidase domain protein  25.76 
 
 
421 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  24.73 
 
 
452 aa  56.6  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  30.11 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  23.45 
 
 
761 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  33.71 
 
 
425 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  23.11 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  21.04 
 
 
429 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0436  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.32 
 
 
447 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0951  (S)-2-hydroxy-acid dehydrogenase  29.55 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3259  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.55 
 
 
376 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0108  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 
457 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.28 
 
 
473 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2653  glycolate oxidase FAD binding subunit  29.57 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.56 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.6 
 
 
457 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2755  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 
357 aa  52.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.878103 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  25.45 
 
 
418 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  29.31 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>