More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0763 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  78.32 
 
 
496 aa  778    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  75.58 
 
 
483 aa  758    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  77.52 
 
 
478 aa  773    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09210  adenosylhomocysteinase  69.84 
 
 
506 aa  705    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.53378  normal  0.263004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.5 
 
 
495 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  84.03 
 
 
478 aa  837    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  71.76 
 
 
488 aa  696    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  87.82 
 
 
476 aa  869    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.47 
 
 
496 aa  774    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3079  adenosylhomocysteinase  73.53 
 
 
484 aa  730    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.439915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  74.74 
 
 
485 aa  756    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05310  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.01 
 
 
519 aa  712    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4286  adenosylhomocysteinase  73.24 
 
 
495 aa  716    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.66 
 
 
485 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.588423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.67 
 
 
486 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0156  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.75 
 
 
491 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1269  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.89 
 
 
492 aa  715    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000838657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.56 
 
 
478 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0163  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.75 
 
 
491 aa  684    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  82.35 
 
 
478 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  71.81 
 
 
487 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.646938  normal  0.0268466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.21 
 
 
491 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0285183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6321  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.42 
 
 
490 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.598676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  83.79 
 
 
475 aa  834    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1837  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.11 
 
 
494 aa  702    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.739236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1336  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.27 
 
 
489 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  100 
 
 
475 aa  983    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.8 
 
 
486 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3640  adenosylhomocysteinase  72.96 
 
 
489 aa  718    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.65 
 
 
498 aa  727    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0161  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.38 
 
 
493 aa  695    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.716929  normal  0.0316991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1198  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.1 
 
 
492 aa  718    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.654496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1234  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  70.8 
 
 
512 aa  696    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.217111  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2526  adenosylhomocysteinase  72.95 
 
 
498 aa  721    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  81.3 
 
 
485 aa  785    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.1 
 
 
476 aa  771    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.682945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0174  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  69.75 
 
 
491 aa  684    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  74.84 
 
 
476 aa  750    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1354  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.27 
 
 
489 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.483366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.06 
 
 
485 aa  707    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1372  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.48 
 
 
489 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.815282  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1642  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.34 
 
 
471 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4075  adenosylhomocysteinase  65.64 
 
 
512 aa  626  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  0.0365971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0671  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.92 
 
 
471 aa  622  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.130844  normal  0.0412083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0807  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 
472 aa  620  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1548  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.19 
 
 
471 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1736  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.03 
 
 
496 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235533  hitchhiker  0.00421364 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2095  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.13 
 
 
471 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.45 
 
 
479 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.21 
 
 
473 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1641  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 
472 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2304  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.47 
 
 
473 aa  609  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.63 
 
 
480 aa  608  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
464 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.42 
 
 
480 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2580  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.69 
 
 
479 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1069  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.82 
 
 
471 aa  605  9.999999999999999e-173  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0921  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.71 
 
 
471 aa  604  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2347  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.29 
 
 
479 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.142273  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18319  adenosylhomocysteinase  61.4 
 
 
481 aa  601  1.0000000000000001e-171  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2301  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.79 
 
 
473 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.87 
 
 
472 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.24 
 
 
469 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
441 aa  593  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
441 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.24 
 
 
476 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  64.42 
 
 
471 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
475 aa  588  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04338  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  60.62 
 
 
480 aa  588  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0193  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.45 
 
 
470 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.551187  hitchhiker  0.00261817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.82 
 
 
472 aa  588  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0500426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3854  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
474 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.79 
 
 
473 aa  591  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0117  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.81 
 
 
472 aa  586  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161182  normal  0.625216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2540  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.37 
 
 
479 aa  585  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3576  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.74 
 
 
465 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.03 
 
 
465 aa  585  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.82 
 
 
477 aa  588  1e-166  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0093  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.71 
 
 
474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0822  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
466 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1514  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.42 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3333  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.71 
 
 
474 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0356  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.16 
 
 
464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.31829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0178  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.58 
 
 
473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1346  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
465 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3247  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  63.12 
 
 
466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0166  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  65.42 
 
 
463 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.539917 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.61 
 
 
472 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.53 
 
 
479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  61.76 
 
 
477 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2938  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  62.39 
 
 
465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>