More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0722 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 
243 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  83.61 
 
 
244 aa  410  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  76.64 
 
 
243 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  75.41 
 
 
243 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  75 
 
 
243 aa  354  7.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  72.73 
 
 
243 aa  342  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  71.72 
 
 
243 aa  322  4e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  54.96 
 
 
242 aa  238  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  33.06 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  29.96 
 
 
241 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.31 
 
 
250 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  29.1 
 
 
263 aa  92  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  32 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.35 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  29.39 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  29.75 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  30.61 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.96 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.98 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.45 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.88 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  27.13 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 
334 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.84 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.53 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  27.89 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  32.18 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  37.38 
 
 
388 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  25.64 
 
 
351 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  26.21 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  26.53 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.98 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  33.02 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  26.12 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  25.42 
 
 
328 aa  63.2  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.74 
 
 
393 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
245 aa  63.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  36.36 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  26.12 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  26.12 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  36.36 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  27.9 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  27.9 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.12 
 
 
400 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  25.42 
 
 
351 aa  62  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  28.51 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.88 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  26.11 
 
 
325 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.78 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  28.57 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  26.13 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  36.94 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  20.31 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  24.64 
 
 
776 aa  59.3  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  25.54 
 
 
325 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  31.45 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  37.23 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  22.22 
 
 
545 aa  59.3  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  26.12 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  32.41 
 
 
384 aa  58.9  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  25.78 
 
 
325 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  24.72 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.12 
 
 
255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  39.64 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  40.37 
 
 
397 aa  58.5  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
238 aa  58.5  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.2 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  23.2 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  22.88 
 
 
348 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.35 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  29.63 
 
 
402 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.5 
 
 
400 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.3 
 
 
400 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  27.65 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.83 
 
 
397 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  34.68 
 
 
397 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  22.63 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0113  nucleotidyl transferase  31.06 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00523302  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
393 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  45.68 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25 
 
 
349 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.71 
 
 
349 aa  56.6  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  32.8 
 
 
439 aa  56.2  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  27.36 
 
 
330 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003947  glucose-1-phosphate adenylyltransferase  39.34 
 
 
405 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.870453  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  31.16 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>