More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0583 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  78.14 
 
 
216 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  72.81 
 
 
217 aa  334  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  74.88 
 
 
217 aa  329  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  75 
 
 
217 aa  328  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  70.97 
 
 
217 aa  323  8.000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  71.76 
 
 
219 aa  318  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  72.09 
 
 
217 aa  315  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  69.3 
 
 
217 aa  312  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  69.3 
 
 
217 aa  310  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  62.27 
 
 
225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  64.79 
 
 
189 aa  265  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  55.09 
 
 
215 aa  259  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  55.19 
 
 
216 aa  258  6e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  55.4 
 
 
217 aa  257  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  53.02 
 
 
215 aa  254  6e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  54.25 
 
 
217 aa  254  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  51.87 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  57.84 
 
 
216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  52.78 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  53.49 
 
 
215 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  53.27 
 
 
217 aa  251  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  57.35 
 
 
211 aa  250  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  52.83 
 
 
214 aa  250  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  57.84 
 
 
217 aa  249  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  53.3 
 
 
216 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  53.3 
 
 
216 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  246  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  59.91 
 
 
204 aa  244  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  51.64 
 
 
213 aa  244  8e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  53.77 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  53.52 
 
 
214 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  53.95 
 
 
216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  52.36 
 
 
213 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  48.37 
 
 
215 aa  241  7e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  53.05 
 
 
214 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  55.4 
 
 
214 aa  240  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  50.23 
 
 
213 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  52.36 
 
 
222 aa  238  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  54.25 
 
 
217 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  52.91 
 
 
217 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  52.8 
 
 
214 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  52.78 
 
 
217 aa  236  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  53.77 
 
 
220 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  51.89 
 
 
214 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  52.45 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  49.06 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  49.77 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.52 
 
 
215 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  51.96 
 
 
216 aa  230  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  51.96 
 
 
216 aa  228  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  51.47 
 
 
216 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  51.47 
 
 
216 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  48.85 
 
 
219 aa  228  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  47.91 
 
 
218 aa  227  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  52.43 
 
 
423 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50.98 
 
 
216 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.67 
 
 
211 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  50.91 
 
 
217 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  44.86 
 
 
214 aa  221  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  50.46 
 
 
215 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  51.61 
 
 
214 aa  221  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  50.23 
 
 
214 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  50.23 
 
 
222 aa  221  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.87 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  52.15 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.76 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  50.69 
 
 
214 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  52.63 
 
 
234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  50.69 
 
 
214 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  47.93 
 
 
228 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  52.63 
 
 
214 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.42 
 
 
217 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  49.77 
 
 
224 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  48.86 
 
 
216 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  55.38 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  47.69 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  49.05 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3205  adenylate kinase  46.61 
 
 
217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129481  normal  0.282312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  49.07 
 
 
216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  52.91 
 
 
214 aa  214  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  54.3 
 
 
218 aa  214  7e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  49.77 
 
 
214 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.83 
 
 
226 aa  214  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  47.71 
 
 
215 aa  214  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  46.85 
 
 
218 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>